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xiangxu

金虫 (小有名气)

[交流] 请教一个网上Check过程中遇到的一个问题!

各位大虾:
我的一个晶体解完后,在网上(IUCr)check时,在A类错误中就出现一个问题:

Alert level A
PLAT940_ALERT_3_A F**2 Refinement with I .GT. n * Sigma(I) only ..          ?

查看其说明是:

PLAT940

--------------------------------------------------------------------------------
PLAT940 Type_3 Test for wR2 refinement with all data
--------------------------------------------------------------------------------

Apparently, observed data with I > n * sigma(I) were used in the F**2
least squares refinement, rather than all observed data.


请教高手,这个错误具体是什么意思?如何解决?
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gujm516

金虫 (小有名气)

在CIF中有下列三行,看看是不是第三行忘写了:

_reflns_number_total              3022
_reflns_number_gt                 1802
_reflns_threshold_expression      I>2\s(I)
2楼2008-07-17 22:29:57
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xiangxu

金虫 (小有名气)

gujm516
谢谢你的提示,我看过,我的cif中,是如下的
_reflns_number_total                    348
_reflns_number_gt                       348
_reflns_threshold_expression             I>2\s(I)

结果在check中还是出现同样的问题
不是是否还有别的办法?

改成与你提示的一样
_reflns_number_total                    348
_reflns_number_gt                       348
_reflns_threshold_expression            >2sigma(I)
3楼2008-07-18 16:20:53
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gujm516

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
xiangxu(金币+3,VIP+0):问题未能解决,不过非常感谢你的热情帮助!
========================================
_reflns_number_total                    348
_reflns_number_gt                       348
_reflns_threshold_expression             I>2\s(I)
========================================

问题就出在 _total     348
                _gt        348

total指的是全部可观察衍射点,而 gt 通常是指>2\s(I)的衍射。即使是P-1空间群,这二个值的差也要在一倍以上。除非你的单晶是合金,且有极高对称性的。

先把 total 改成 1000 去check试试,然后再到你的原始数据里去找原因。
4楼2008-07-18 22:46:50
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