应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 【求助】关于autodock的一个小问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
81/1返回列表
查看: 614  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

foradun

[交流] 【求助】关于autodock的一个小问题

autodock中对接后配体和受体的结合能量大概多少算是结合比较好，我筛选了些化合物，大部分都是-8点多。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2008-07-17 17:26:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxffliu

铜虫 (小有名气)
★
suntao1982(金币+1,VIP+0):xiexie
没有固定的标准，但是至少要是负的。你看看换算成的Ki大概是多少，就能心里有个数了。另外能量打分只是参考，筛好了还是去测活性吧。
赞一下(10人) 回复此楼
2楼2008-07-17 17:56:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
★
suntao1982(金币+1,VIP+0):xiexie
如果不考虑实际，只以autodock的打分来看的话，那么＜－12为最好，至少也应该在－8到－12之间吧，另外，Ki至少应该在nM的水平，表明结合较强，可以进行进一步的研究
赞一下(10人) 回复此楼
个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
3楼2008-07-17 18:59:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

foradun

最近筛选了一批类似物，跟蛋白的结合里和位点都差不多，但是测活性相差很大，这个要怎么解释好呢？
赞一下 回复此楼
4楼2008-07-18 08:02:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
★ ★
suntao1982(金币+2,VIP+0):xiexie
你是指用药理实验的手段测活性吗？那样的话，这很正常 ，因为能结合只是说能量匹配和几何匹配较好，但具体在体内的作用就不得而知了，比如它的穿透性怎么样？他能到达蛋白处与蛋白作用么？这样就可以解释了啊
赞一下(10人) 回复此楼
个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
5楼2008-07-18 09:44:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

foradun

嗯嗯 谢谢楼上 哈哈
赞一下 回复此楼
6楼2008-07-18 12:35:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jlz3278

金虫 (小有名气)
问个弱弱的问题，那知道结合能后怎么得到Ki值呢？
赞一下 回复此楼
7楼2008-07-20 08:14:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

foradun

ki值就在结合能下面，点conformations--load就能看到。
赞一下 回复此楼
8楼2008-07-21 16:13:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 foradun 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 343求调剂 +8 爱羁绊 2026-03-29 8/400 2026-04-03 22:19 by 柟�?
[考研] 考研调剂 +5 小sun要好运 2026-04-03 5/250 2026-04-03 21:43 by 啵啵啵0119
[考研] 286求调剂 +8 lim0922 2026-04-02 8/400 2026-04-03 20:19 by rzh123456
[考研] 310求调剂 +18 争取九点睡 2026-03-30 18/900 2026-04-03 18:35 by ls刘帅
[考研] 266求调剂 +3 08电气工程 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:05 by 1753564080
[考研] 数一英一285求调剂 +7 AZMK 2026-04-03 9/450 2026-04-03 13:03 by ms629
[考研] 一志愿山东大学化学与化工学院材料与化工专硕，360分求调剂 +4 不愿透露姓名的� 2026-04-02 4/200 2026-04-03 09:29 by 遗忘消失的灆
[考研] 一志愿山东大学，085600，344 +7 魏子per 2026-04-02 8/400 2026-04-02 21:12 by 百灵童888
[考研] 413求调剂 +3 柯某某 2026-03-31 3/150 2026-04-02 16:59 by zzsw+
[考研] 283求调剂 +3 jiouuu 2026-04-02 4/200 2026-04-02 14:08 by 哒哒哒呱呱呱
[考研] 材料化工340求调剂 +5 jhx777 2026-03-30 5/250 2026-04-02 12:45 by smileboy2006
[考研] 070300化学279求调剂 +15 哈哈哈^_^ 2026-03-31 17/850 2026-04-01 21:37 by 给你你注意休息
[考研] 353求调剂 +4 拉钩不许变 2026-04-01 4/200 2026-04-01 18:10 by 记事本2026
[考研] 291求调剂 +3 迷蒙木木 2026-04-01 4/200 2026-04-01 11:07 by 逆水乘风
[考研] 070300化学354求调剂 +15 101次希望 2026-03-28 15/750 2026-03-31 17:58 by jp9609
[考研] 英一数一总分334求调剂 +4 陈阳坤 2026-03-31 4/200 2026-03-31 14:22 by 记事本2026
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-29 3/150 2026-03-31 10:06 by cal0306
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-31 4/200 2026-03-31 10:04 by cal0306
[考研] 08工科求调剂286 +5 tgs_001 2026-03-28 5/250 2026-03-31 08:18 by 一只好果子?
[考研] 数一英一271专硕（085401）求调剂，可跨 +7 前行必有光 2026-03-28 8/400 2026-03-28 23:22 by 小木虫tim
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭