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jingnidai

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[交流] 中科院化学专业数据库介绍

中科院化学专业数据库，由上海有机所建设，网站地址 http://202.127.145.134/scdb
http://202.127.145.134/default.htm
。
网站需要注册，注册后即可免费使用所有数据库。

化学专业数据库目前已经建设完成19个方面的数据内容与技术，分别是化合物结构数据库、化学反应数据库、红外谱图数据库、质谱谱图数据库、化学物质分析方法数据库、药物与天然产物数据库、中药与有效成分数据库、化学配方数据库、毒性化合物数据库、化工产品数据库、中国化学文献数据库、化学核心期刊(英文)数据库、专业情报数据库、精细化工产品数据库、生物活性数据库、工程塑料数据库、化合物名称翻译、结构处理技术共享和化学网络资源数据库等。

化合物名称翻译
目前只开放了名称英译中的功能，基本按照CA/IUPAC的命名规则进行翻译。
化合物名称中---->英的翻译功能还在测试中，稳定之后即可向公众开放。

化合物结构数据库
收录了2,200,000多个化合物，多库融合检索平台将多个不同类型，不同结构，不同软件支持的本地及异地数据库置于一个统一检索平台，使用户可以同时从各个不同数据库检索信息，也可以只选择一个数据库进行检索。通过全结构检索，子结构检索以及模糊结构检索可查出目标化合物的物化性质，二维、三维结构，红外光谱图，质谱谱图，相关参考文献等。

化学反应数据库
覆盖了国内外化学文献中报道的化学反应200万余条，检索途径为化学反应物检索，反应产物检索，反应溶剂、催化剂检索及组合检索等，可获取相关反应信息及参考文献等，对反应机理研究，合成路线设计具有相当参考意义。

红外谱图数据库
收录了大约15万多个化合物，通过特定格式转化的红外光谱文件以峰位检索，强峰检索，功能团检索以及组合检索，也可以通过化合物名称，化合物分子式检索，获取需要的化合物，主要包括其红外光谱图，物化性质以及CA登录号等信息。

质谱谱图数据库
收录了大约12,000多个化合物，检索途径为质荷比检索，丰度检索以及组合检索，可获取化合物质谱谱图，物化性质等信息。

药物与天然产物数据库
覆盖来自不同数据库的药物和天然产物信息资源，其中药物信息15万多条，主要是关于药物的物化性质、相关专利以及参考文献，另外还包括14万多个天然产物信息和1万多条相关专利。

中药与有效成分数据库
将数千年来中国传统中医的临床实践融合成一个内涵丰富疾病用药—中药药材—化合物性质的多层次信息数据库，其中包括了50,000余个处方，1,400多种疾病用药。

化学核心期刊数据库
收录了1990年—2006年国外化学期刊文献共200万余篇，检索途径为关键字检索，作者名检索，期刊名检索，发行机构名检索以及高级组合检索。

中国化学文献数据库
收录了1990年—2006年国内化学期刊文献共569,204篇，检索途径为关键字检索，作者名检索，期刊名检索，发行机构名检索以及高级组合检索。同时还可以提供其他入口检索，比如图表信息、化合物、各项实验数据检索。

化工产品数据库
收录了共16,000多家国内化学化工产品供应厂商，以及共67,000多条化工产品信息。检索途径为，供应厂商检索，产品检索以及组合检索，可获取产品厂商，产品物化性质，以及产品价格等信息。

毒性化合物数据库
收录了大约150,000个毒性化合物，检索途径为化合物名称检索，化合物分子式检索，CA登录号检索，主要包括了化合物物化性质，美国毒性化合物标准，相关毒性实验，以及各国职业场所毒性化合物暴露限度等信息。

精细化工产品数据库
收录了药物、农药、颜料、涂料、染料、高分子功能材料、生物化学品、日用化学品、无机化工产品、胶粘剂、食品添加剂、饲料添加剂、化工助剂、农药混剂和中药饲料添加剂共16类精细化工产品，总计1万3千多种。

中国化学专利数据库
收录了大约5万8千多条中国化学化工领域的专利文摘，检索途径为专利名称，专利号，申请人，发明人，CA登录号检索，主要包括了专利内容、专利号、发明人、申请日期、公开日期、摘要等信息。

生物活性数据库
生物活性数据库收录了54万多条生物、生理活性和生态学数据。可提供化合物信息以及各种实验数据的检索。
[search]化学数据库[/search]

[ Last edited by jingnidai on 2008-7-17 at 16:39 ]

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1楼2008-07-17 16:10:02

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检索须知

化学专业数据库的检索须知

一、系统的准备

1）建议用户采用 IE浏览器4.0以上，推荐是IE5以上的版本。
其他浏览器例如FF等可能无法正确加载程序。

分辨率至少800*600，推荐1280 * 1024，或以上。
你屏幕大就可以分辨率更好。

2）化合物结构的检索输入、显示，和红外谱图、质谱谱图的显示，都需要加载java插件，才能正常使用。
一般来说，普通设置下的浏览器会自动加载这个程序。如果您的浏览器无法显示该区域，请记得查看下是否是因为您的浏览器禁用了java。

3）部分结果以弹出窗口式打开，如果您点击某连接无反应，请查看您的浏览器是否禁止了弹出窗口。

二、检索的输入
1）通常，化合物的检索都接受 CAS号码、化合物英文名称、分子式三项检索。
只有少数数据库接受中文名称输入，请注意检索提示。
**化合物英文名称中，如果有单引号 ' ，可能会出错。
**CAS号码有无短划线均可，如 50-00-0，50000。

2）部分数据库只显示命中的前100条结果，如果您需要查看更多结果，请调整您的输入。

3）化合物结构数据库与反应数据库接受化合物结构的输入，您可以使用网页上的小程序输入结构进行检索。

4）中药数据库除了化合物名称之外，都接受中文名词输入，比如药材的名称，方剂的名称，等等。

三、红外数据库的检索
其它数据库的检索对于用户来说，比较容易理解。
红外数据库是使用频率很高的数据库，可以检索指定化合物的谱图，也可以检索与某谱图相似的化合物。
1）红外谱图文件
后一种检索，可以通过手动输入少量特征峰，也可以通过上载指定格式的谱图文件来进行检索。
这种指定的nyy格式文件需要转换，网站提供了格式转换的小程序下载。
除此之外，您提供的原始数据文件的格式也得符合要求。
示例：
第一列为波数（cm-1）,第二列为透过率(%)
________________
399.36 74.894
401.29 75.292
403.22 75.566
405.14 75.609
407.07 75.949
409 76.368
410.93 76.452
412.86 76.45
...............................

2）检索参数的选择
在检索参数选择的页面上，您可以看到您的谱峰数据，也可以在页面下端的按钮点开谱图。

如果一套检索参数无法检索出结果，您可以调整参数。
需要注意参数页面的最后一项：容许误差范围，并不是越大越好。
容许的误差越大，带来的干扰也会越大。
适当降低一点误差范围，也许能得到更准确的结果。

如果您的谱图上都是强峰，您可以适当提高强峰的权重，比如从1.0变成1.5，甚至1.75。这可能会让您的目标谱图脱颖而出，注意，只是可能。

另外，比较直接的调整就是降低"谱图相似度"的门槛，这样就会得到更多的结果。

(大家还有什么问题，可以提问)

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2楼2008-07-17 16:39:09

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化学专业数据库的特色服务（包括即将开放的）

化学专业数据库，内容覆盖了化学领域的大部分应用，目前比较倾向于有机化学，有机所建的么。

特色服务：
1）化合物名称翻译，目前已经开放英译中功能

2）化合物命名系统（开发中，未开放）
用户输入化合物结构，可得到符合IUPAC命名规则的化合物名称，适合于化学初学者。

3）化合物结构处理技术web共享
有机所的结构处理技术是自主开发的核心技术，本项服务主要适合于单位用户。
单位用户可以通过此技术，建立自己的化合物数据库以及检索功能。

4）化合物集成检索（开发中）
集成检索就是，可以从任何一个化合物的性质数据库检索进去，可以查到该化合物所有的相关信息，包括文献、反应等等。

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3楼2008-07-18 13:29:07

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