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真高兴

新虫 (初入文坛)

[求助] 转录组 已有1人参与

请问转录组差异表达基因topGO富集结果中有向无环图的节点能说明什么问题？
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1楼 2015-05-18 22:41:29
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把图传上来看看吧
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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭
2楼2015-05-21 08:59:02
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

额！最显著的肯定是个差异表达基因最相关的。 如果 你是研究疾病的，那么说明 该GO功能与疾病的关系最密切，这个就是结果
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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭
7楼2015-05-23 16:32:36
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普通回帖

真高兴

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-05-21 08:59:02
把图传上来看看吧

图片已经上传了，但是不知道是否可以看清楚
转录组
T02_vs_T01.topGO_CC.png
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3楼2015-05-21 22:10:33
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

★
真高兴(晞朔代发): 金币+1 2015-05-23 16:57:51
看到了。 这是一个GO富集结果的有向图。
图中的箭头表示GO分级。
颜色表示富集的显著性。颜色越深，说明富集结果越显著。
至于那些没有颜色的GO节点，在网络中属于间接链接的作用。
主要讨论的还是那些最显著的。
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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭
4楼2015-05-22 08:40:17
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真高兴

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-05-22 08:40:17
看到了。 这是一个GO富集结果的有向图。
图中的箭头表示GO分级。
颜色表示富集的显著性。颜色越深，说明富集结果越显著。
至于那些没有颜色的GO节点，在网络中属于间接链接的作用。
主要讨论的还是那些最显著的 ...

感谢您的回答。
最显著的能说明什么问题啊，如何进一步分析，请给我指点
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5楼2015-05-22 21:36:31
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲，勿施于人
搭车问下楼主这个图是怎么做出来的？
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The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
6楼2015-05-23 03:23:14
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真高兴

新虫 (初入文坛)
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6楼: Originally posted by fuyuandj86 at 2015-05-23 03:23:14
搭车问下楼主这个图是怎么做出来的？

这个是测序公司做的，我也不清楚具体怎么做
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8楼2015-08-22 22:05:25
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yubb

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-05-22 08:40:17
看到了。 这是一个GO富集结果的有向图。
图中的箭头表示GO分级。
颜色表示富集的显著性。颜色越深，说明富集结果越显著。
至于那些没有颜色的GO节点，在网络中属于间接链接的作用。
主要讨论的还是那些最显著的 ...

你好 现在也在做相关分析 想请教一下 方框和椭圆有什么不一样的意义呢
赞一下 回复此楼
9楼2018-03-15 11:05:17
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yubb

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-05-22 08:40:17
看到了。 这是一个GO富集结果的有向图。
图中的箭头表示GO分级。
颜色表示富集的显著性。颜色越深，说明富集结果越显著。
至于那些没有颜色的GO节点，在网络中属于间接链接的作用。
主要讨论的还是那些最显著的 ...

你好 现在也在做相关分析 想请教一下 方框和椭圆有什么不一样的意义呢
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10楼2018-03-15 11:05:19
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