24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1388  |  回复: 10

真高兴

新虫 (初入文坛)

[求助] 转录组已有1人参与

请问转录组差异表达基因topGO富集结果中有向无环图的节点能说明什么问题?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把图传上来看看吧
你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
2楼2015-05-21 08:59:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

额!最显著的肯定是个差异表达基因最相关的。 如果 你是研究疾病的,那么说明 该GO功能与疾病的关系最密切,这个就是结果
你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
7楼2015-05-23 16:32:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

真高兴

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-05-21 08:59:02
把图传上来看看吧

图片已经上传了,但是不知道是否可以看清楚
转录组
T02_vs_T01.topGO_CC.png

3楼2015-05-21 22:10:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖


真高兴(晞朔代发): 金币+1 2015-05-23 16:57:51
看到了。 这是一个GO富集结果的有向图。
图中的箭头表示GO分级。
颜色表示富集的显著性。颜色越深,说明富集结果越显著。
至于那些没有颜色的GO节点,在网络中属于间接链接的作用。
主要讨论的还是那些最显著的。
你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
4楼2015-05-22 08:40:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

真高兴

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-05-22 08:40:17
看到了。 这是一个GO富集结果的有向图。
图中的箭头表示GO分级。
颜色表示富集的显著性。颜色越深,说明富集结果越显著。
至于那些没有颜色的GO节点,在网络中属于间接链接的作用。
主要讨论的还是那些最显著的 ...

感谢您的回答。
最显著的能说明什么问题啊,如何进一步分析,请给我指点
5楼2015-05-22 21:36:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人

搭车问下楼主这个图是怎么做出来的?
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
6楼2015-05-23 03:23:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

真高兴

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by fuyuandj86 at 2015-05-23 03:23:14
搭车问下楼主这个图是怎么做出来的?

这个是测序公司做的,我也不清楚具体怎么做
8楼2015-08-22 22:05:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yubb

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-05-22 08:40:17
看到了。 这是一个GO富集结果的有向图。
图中的箭头表示GO分级。
颜色表示富集的显著性。颜色越深,说明富集结果越显著。
至于那些没有颜色的GO节点,在网络中属于间接链接的作用。
主要讨论的还是那些最显著的 ...

你好 现在也在做相关分析 想请教一下 方框和椭圆有什么不一样的意义呢
9楼2018-03-15 11:05:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yubb

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-05-22 08:40:17
看到了。 这是一个GO富集结果的有向图。
图中的箭头表示GO分级。
颜色表示富集的显著性。颜色越深,说明富集结果越显著。
至于那些没有颜色的GO节点,在网络中属于间接链接的作用。
主要讨论的还是那些最显著的 ...

你好 现在也在做相关分析 想请教一下 方框和椭圆有什么不一样的意义呢
10楼2018-03-15 11:05:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 真高兴 的主题更新
信息提示
请填处理意见