24小时热门版块排行榜    

查看: 487  |  回复: 3
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

polestar007

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】discover模块计算相互作用能

大家好,我是新手,正在按照2006.12华南师范大学的那份教程学习MS,现在遇到一个疑问,急需大家的帮助!

1、在“聚合物与金属氧化物表面的相互作用”一部分,为什么我找不到“Total otential Energy(总势能)”这一项呢?请问是指下面这个数值吗?如果是的话,我在重复文献中的计算时为什么差别在一个数量级呢?
Energy components             kcal/mol
Total:                    32509.108728
  Internal:                 158.548601
    Bond:                    58.138645
    Angle:                  116.004938
    Torsion:                -16.574563
    OutOfPlane:               1.205447
    Cross:                   -0.225865
      BondBond:               0.027200
      BondAngle:             -0.253065
      EndBondTorsion:         0.000000
      MiddleBondTorsion:      0.000000
      AngleTorsion:           0.000000
      AngleAngleTorsion:      0.000000
      BondBond-1-3:           0.000000
      AngleAngle:             0.000000
  Nonbond:                32370.240627
    Vdw:                  32465.711095
      Repulsive:          48026.788439
      Dispersive:         -15561.077343
    Electrostatic:          -95.470468
    Hydrogenbond:             0.000000
  Restraint:                -19.680500
    BtclRestraint:          -19.680500

2、当吸附物为一个离子型化合物时(如阴离子表面活性剂CTAB),应该怎么指派电荷呢?

谢谢!

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-26 at 16:29 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

匏土革,木石金。丝与竹,乃八音。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bubuweiying

金虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by polestar007 at 2008-07-15 16:48:01:
大家好,我是新手,正在按照2006.12华南师范大学的那份教程学习MS,现在遇到一个疑问,急需大家的帮助!

1、在“聚合物与金属氧化物表面的相互作用”一部分,为什么我找不到“Total otential Energy(总势能) ...

你好,我是个新手,在这一部分中,我算总势能时老出错,请帮忙看一下是啥原因啊,谢谢
FORCEFIELD OPTIONS
__________________

Filename                  : compass.frc
Definition name                  : cff91
Version                          : 2.8
Last modification date          : 3/6/2007
# of automatic parameters : 0
Error: User: Error calculating energy
    while executing
"energy print +energies"

Total time used by DISCOVER: 0.44 secs

Completion date: Sat Aug 27 14:23:42 2011
Exiting Discover: An ERROR has occurred!
春天花会开!
5楼2011-08-27 14:43:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

fspdlh

金虫 (正式写手)


suntao1982(金币+1,VIP+0):谢谢交流!
就是total项,指的是总势能。
可以在modify中选charge进行修改,但要注意力场类型是不是要改
2楼2008-07-15 22:47:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

polestar007

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by fspdlh at 2008-7-15 22:47:
就是total项,指的是总势能。
可以在modify中选charge进行修改,但要注意力场类型是不是要改

十分感谢!请问能将charge中的几个选项介绍一下吗?我弄不清楚他们之间的区别!谢谢!
匏土革,木石金。丝与竹,乃八音。
3楼2008-07-16 08:24:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ANUsWpSnuWQD 2026-08-06 3/150 2026-08-07 02:06 by nSM3ys5fefM3
[基金申请] 听说今天filecode变了 +19 布布和一二 2026-08-06 33/1650 2026-08-07 01:25 by 云上清扬
[基金申请] 基金中了 +6 laoda193707 2026-08-06 6/300 2026-08-06 23:34 by dragonxp
[基金申请] filecode +10 等待解的谜 2026-08-06 14/700 2026-08-06 21:16 by zhanghaozhu
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +3 archvillain 2026-08-06 7/350 2026-08-06 21:05 by archvillain
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 6/300 2026-08-06 20:19 by 苏知砚
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备? 50+3 kf2781974 2026-07-31 12/600 2026-08-06 15:11 by eddyin
[教师之家] 咨询面上基金 +4 李长云 2026-07-31 7/350 2026-08-06 11:20 by 李长云
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +22 低垂的野花 2026-07-31 30/1500 2026-08-05 18:03 by 低垂的野花
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +3 哈哈114477 2026-08-01 3/150 2026-08-04 15:40 by tegsgjy20
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 娱乐 +4 Tide man 2026-08-03 4/200 2026-08-04 11:51 by wgch518
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见