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linlinyu9898

新虫 (小有名气)

[交流] python读取文件的问题 已有3人参与

如何用Python语言按段读取文件?比如说一共有10个patch,每个patch里有80个残基,怎么编写程序使其一个patch一个patch的读完整个文件。每个patch的开头是PATCH0,PATCH1.......PATCH10,希望用Python的条件语句和循环语句编写。
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me_yu

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
文件格式?具體什麼條件?
听,寂静的夜里,田野里蛙声和虫鸣,好不欢快!
2楼2015-05-14 11:27:17
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Vic_

铁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
CODE:
patch = ""
for i in xrange(1,11):
    open file('PATCH'+str(i),'r') as f:
        patch += f.read()

3楼2015-05-14 11:31:56
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linlinyu9898

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by me_yu at 2015-05-14 11:27:17
文件格式?具體什麼條件?

文件格式是txt,在Linux系统下运行。用Python的条件语句和循环语句来编写。
4楼2015-05-14 18:34:56
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linlinyu9898

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Vic_ at 2015-05-14 11:31:56
patch = ""
for i in xrange(1,11):
    open file('PATCH'+str(i),'r') as f:
        patch += f.read()

谢谢,我试试。
5楼2015-05-14 18:36:04
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liu2012huan

铜虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
表示没看懂需求,上文件格式。
图像检索,图像处理,机器学习。
6楼2015-05-14 23:07:21
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linlinyu9898

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by liu2012huan at 2015-05-14 23:07:21
表示没看懂需求,上文件格式。

可以把这个文件在Linux系统下改成Txt格式。具体要求就是:对每个patch里的残基加上偏好性,举例来说,patch0里的残基ARG,它的偏好性为2,对2取对数lg2,每个残基的偏好性都不同,已知每个残基的偏好性,取对数后,计算算术平均值,然后将平均值与Q*A的值加和。每个patch都做相同的处理,最后把patch的Q*A的值从大到小重新排序。
用python编写程序完成上述要求,不知道能不能帮忙编写?刚刚接触Python,只学了基础,具体应用很不熟练,希望指教,谢谢。

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  • 附件 1 : 2DR5_r.patch.doc
  • 2015-05-15 19:01:35, 359.83 K
7楼2015-05-15 19:12:12
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liu2012huan

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by linlinyu9898 at 2015-05-15 19:12:12
可以把这个文件在Linux系统下改成Txt格式。具体要求就是:对每个patch里的残基加上偏好性,举例来说,patch0里的残基ARG,它的偏好性为2,对2取对数lg2,每个残基的偏好性都不同,已知每个残基的偏好性,取对数后, ...

明天我具体看下

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
图像检索,图像处理,机器学习。
8楼2015-05-16 00:26:45
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