| 查看: 978 | 回复: 11 | |||
| 【奖励】 本帖被评价11次，作者athenatzy增加金币 8.8 个 | |||
[资源]
生物分子模拟方法_英文原版
|
|||
|
Biomolecular Simulation methods and protocols PARTI QUANTUM MECHANICS CALCULATIONS 1 Ab Initio, Density Functional Theory, and Semi-Empirical Calculations . . . . . . . . . 3 2 Ab Initio Molecular Dynamics. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 3 Introduction to QM/MM Simulations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43 4 Computational Enzymology . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67 5 QM and QM/MM Simulations of Proteins. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 PART II CLASSICAL MECHANICS: ATOMISTIC SIMULATIONS 6 Classical Molecular Dynamics in a Nutshell . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 7 Enhanced Sampling Algorithms . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 8 Force Fields for Classical Molecular Dynamics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 197 9 Polarizable Force Fields . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 215 10 Electrostatics Interactions in Classical Simulations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243 11 An Introduction to Best Practices in Free Energy Calculations. . . . . . . . . . . . . . . . . 271 12 Recipes for Free Energy Calculations in Biomolecular Systems. . . . . . . . . . . . . . . . . 313 13 Molecular Docking Methodologies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339 14 Simulation Studies of the Mechanism of Membrane Transporters . . . . . . . . . . . . . . 361 15 Molecular Dynamics Simulations of Lipid Bilayers: Simple Recipe of How to Do It . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 407 16 Simulations of Lipid Monolayers. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 431 17 Simulating DNA by Molecular Dynamics: Aims, Methods, and Validation. . . . . . . 445 18 Simulation of Carbohydrates, from Molecular Docking to Dynamics in Water . . . 469 PART III MESOSCOPIC SIMULATIONS AND COARSE-GRAINED MODELS 19 Systematic Methods for Structurally Consistent Coarse-Grained Models . . . . . . . . 487 20 The Martini Coarse-Grained Force Field . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 533 21 Multiscale Molecular Modeling. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 567 22 Coarse-Grained Models for Protein Folding and Aggregation . . . . . . . . . . . . . . . . . 585 23 Elastic Network Models: Theoretical and Empirical Foundations . . . . . . . . . . . . . . 601 24 An Introduction to Dissipative Particle Dynamics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 617 25 Multiscale Molecular Dynamics Simulations of Membrane Proteins . . . . . . . . . . . . 635 26 Vesicles and Vesicle Fusion: Coarse-Grained Simulations. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 659 |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 生物分子模拟.pdf
2015-05-13 13:38:14, 11.94 M
» 猜你喜欢
急需审稿人！！！
已经有3人回复
-
申博/考博
已经有8人回复
-
一志愿A区211，22408 321求调剂
已经有8人回复
-
295分求调剂
已经有6人回复
-
一志愿中科大材料与化工，353分还有调剂学校吗
已经有13人回复
-
085600材料与化工调剂
已经有6人回复
-
期刊推荐
已经有5人回复
-
有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业
已经有7人回复
-
又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗
已经有4人回复
-
337求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求结构生物学或者分子模拟，分子对接的老师
已经有61人回复
- 分子生物学入门者求助学习方法和技术
已经有13人回复
- 剑桥大学--范德华力精品教材《Van der Waals Forces_ A Handbook for Scientists》
已经有168人回复
- 这样的分子结构图是用什么分子模拟结构的画图软件？
已经有6人回复
- 生物背景的人，学习分子模拟需要补充什么知识？
已经有4人回复
- 分子模拟经典著作：分子模拟：从算法到应用英文版
已经有198人回复
- 我们课题组招聘，MD 模拟方面——最好精于NAMD gromacs 做生物分子模拟
已经有55人回复
2楼2015-05-13 14:07:57
简单回复
胡画3楼
2015-06-05 00:39
回复
五星好评 谢谢分享
simit4楼
2015-07-21 07:51
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
2015-11-24 22:53
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
licro6楼
2015-12-06 19:29
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
xx14087楼
2016-04-25 09:27
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
wwghost8楼
2016-11-10 09:23
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
2017-04-07 22:50
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
tflin8010楼
2017-11-21 21:56
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
DavidYu33311楼
2019-05-05 16:59
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
311532112楼
2020-11-19 17:37
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
5