24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

mandywang

铁虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 10.2
散金: 152
红花: 2
帖子: 403
在线: 151.3小时
虫号: 1774311
注册: 2012-04-23
专业: 果树学

[求助] heatmap 图解读已有1人参与

做了微生物的高通量测序，公司又给了heatmap图，想请教大侠们这个图怎么解读呢，
有没有什么比较好的文献或是学习资料可以推荐的呢，谢谢了

回复此楼

» 猜你喜欢

inging

1楼 2015-05-06 21:12:37

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

静雯

银虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1397.4
红花: 1
帖子: 42
在线: 32.1小时
虫号: 2364113
注册: 2013-03-20
专业: 抗肿瘤药物药理

【答案】应助回帖

Heatmap 可以用颜色变化来反映二维矩阵或表格中的数据信息，它可以直
观地将数据值的大小以定义的颜色深浅表示出来。常根据需要将数据进行聚类，
将聚类后的数据表示在heatmap 图上，通过颜色的梯度及相似程度来反映数据
的相似性和差异性。如在属水平上对样品和  OTU 类型（样品所含菌属）进行聚
类（依据是不同样品中各  OTU 所含序列数越相近，即所含菌属数量越相近，样
品间相似性越高）  ，对聚类后各样品中不同  OTU（不同菌属）所含序列的丰度
作  heatmap 图，能够反映出在菌属水平上各样品菌落结构的相似性和差异性