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yuyangzap

新虫 (正式写手)

[求助] 酯化反应速率常数的计算

量化新虫子一枚,接触Gaussian计算一些C5-C10一元羧酸和多元醇(季戊四醇,双季戊四醇等)的酯化反应,目前就是一分子的羧酸和一分子的多元醇发生反应,得到了反应的焓变和Gibbs自有能变,想计算反应速率常数,不会使用polyrate软件,看到有的虫友使用过渡态理论计算。我也采用这种方式计算。分别使用了Total Bot计算(不加零点能矫正)和Bot(V=0)使用了零点能矫正。有以下问题,求各位帮忙,谢谢!
1.使用过渡态理论计算反应速率时候需要使用活化能Ea,这个Ea的值是使用焓变值还是使用自由能变值?过渡态理论公式的单位是多少呢?我感觉这个过渡态计算的反应速率常数都是1级反应啊,因为我按照公式推导它的单位是1/s,也就是说guassian计算的反应都是元反应吗?
2.过渡态理论计算是需要过渡态的配分函数和反应物的配分函数,我的反应时A+B→C→TS→D,这样我是使用C和TS的配分函数就可以了吗?还是使用TS的配分函数和A、B的配分函数?
3.我做的一系列反应的焓变自由能大概43±2kcal/mol,如果按照吉布斯自由能算47±2kcal/mol,文献报道活化能的大概是47.5±3.5kcal/mol。我这些数据和文献符合吗?还是我应该使用自由能变化作为活化能?按照我的△H作为活化能依据过渡态理论计算反应速率常数结果在下面,依据△G作为活化能计算反应速率常数的结果也在下面,我想知道这样的速率常数的值是不是太小了?按照这些速率常数的值计算的半衰期都好大(t=0.693/k),有的都几千上万小时,T为498.15K下。这样的反应能发生吗?

酯化反应速率常数的计算
过渡态理论


酯化反应速率常数的计算-1
△H作为活化能计算反应速率常数


酯化反应速率常数的计算-2
△G作为活化能计算反应速率常数
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啦啦啦啦啦啦啦啦
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计算化学新人

铜虫 (小有名气)

哇。楼主以上问题解决了吗,我也着手在算这些,多多指导啊
2楼2016-08-03 15:06:56
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