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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 质子是应该加在羧基上还是水上？
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铁杆木虫 (著名写手)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
agou: 金币+3, 谢谢你的建议。看你的学热力学的，对氢键还很精通么？ 2015-04-26 16:36:29
你的羧基的配位方式是什么样的？是螯合还是单齿配位？单质配位的话能形成合理的氢jian你就可以把氢加在未配位的羧基上，气体还是这个羧基的键长相对于配位的羧基 长一些或者至少比较接近。不是这样的话你就加在水上。
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11楼2015-04-23 17:30:42
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新虫 (正式写手)
★
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2楼: Originally posted by lich666 at 2015-04-23 11:06:33
先看数据好不好，如果好的话可以看到氢的Q峰。
再看羧基键长，键长如果大于1.3，氢就应该在这个键上。
最好所有的氢都有氢键联系，才好修收敛。

老师您好   最近我在解析一个晶体数据的时候发现一个羧基没有脱去质子，但是加不上去氢。键长为1.285,1.224.从键长来看应该是脱掉质子的，但是Grow不了，同时假如该羧基脱掉了质子，则电荷不平衡。数据质量一般偏差，客体分子并没有定出来，（有可能会影响电荷平衡）想请教一下是数据太差造成的加氢加不上么？有什么办法解决么？非常感谢。
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12楼2016-03-06 12:29:38
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2楼: Originally posted by lich666 at 2015-04-23 11:06:33
先看数据好不好，如果好的话可以看到氢的Q峰。
再看羧基键长，键长如果大于1.3，氢就应该在这个键上。
最好所有的氢都有氢键联系，才好修收敛。

老师您好   最近我在解析一个晶体数据的时候发现一个羧基没有脱去质子，但是加不上去氢。键长为1.285,1.224.从键长来看应该是脱掉质子的，但是Grow不了，同时假如该羧基脱掉了质子，则电荷不平衡。数据质量一般偏差，客体分子并没有定出来，（有可能会影响电荷平衡）想请教一下是数据太差造成的加氢加不上么？有什么办法解决么？非常感谢。
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13楼2016-03-06 12:29:47
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2楼: Originally posted by lich666 at 2015-04-23 11:06:33
先看数据好不好，如果好的话可以看到氢的Q峰。
再看羧基键长，键长如果大于1.3，氢就应该在这个键上。
最好所有的氢都有氢键联系，才好修收敛。

老师您好   最近我在解析一个晶体数据的时候发现一个羧基没有脱去质子，但是加不上去氢。键长为1.285,1.224.从键长来看应该是脱掉质子的，但是Grow不了，同时假如该羧基脱掉了质子，则电荷不平衡。数据质量一般偏差，客体分子并没有定出来，（有可能会影响电荷平衡）想请教一下是数据太差造成的加氢加不上么？有什么办法解决么？非常感谢。
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14楼2016-03-06 12:29:53
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