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[求助]
用MS如何构建交联反应？？？ 急求 谢谢各位大神
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构建所用单体为双酚A型环氧树脂和固化剂异佛尔酮二胺， 1，文献说在构建三维分子结构时，要对能量优化后的分子结构进行开环处理及移出末端的活性氢，我是直接移出要移除的原子，不知道正确不正确？？？ 2，在构建三维分子结构时，所用的单体是不是必须是分子型的，我把单体末端的活性氢移出之后，在构建时，总是说任务失败？？？ 3，在构建时，交联反应是在如何的操作下进行的？？？  双酚A型环氧树脂（DGEBA）.png  异佛尔酮二胺（IPD）.png |
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第一步：构建交联环氧树脂聚合物模型。 （1）基于一个原子一个原子的方式建立DGEBA和IPD单体的二维活性结构模型。利用MS Discover模块分别对其进行能量最小化计算，优化初始分子结构的能量以获得合理的三维分子结构。对能量优化后的分子结构进行开环处理并移除末端官能基团上的活性氢，剩下含有碳和氧反应位点的分子片段用于下一步建立初始的周期性三维分子结构。开环处理后，非端基活性氧反应位点需进行加氢处理，使其成为羟基。 （2）在MS Amorphous Cell模块中按照反应基团2：1的化学计量比将16条DGEBA分子链和8条IPD分子链放入预先定义好的三维盒子内。所用的方法是Theodorou和Suter提出的“随机自避行走”方法。 这是我摘抄的一点操作步骤，希望大神帮忙 |
2楼2015-04-17 18:47:28
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
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专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
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- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
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1、self-avoiding walk（SAW）在AC模块的一篇参考文献有提到这个，不知道AC模块会不会默认支持SAW，除了这个reference提到，其他地方没找到这个关键词 Meirovitch, H.J. "Computer Simulation of Self-Avoiding Walks: Testing the Scanning Method", J. Chem. Phys., 79, 502 (1983). 2、交联过程我觉得和这个思路相近 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8449329 活性分子放入AC晶胞，邻近的活性点手动交联 |
3楼2015-04-20 08:57:56
4楼2020-05-30 16:26:43