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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » GaussView打开不饱和结构自动加氢
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

[求助] GaussView打开不饱和结构自动加氢 已有1人参与

MS里构建的不饱和结构，Al2C，导出为mol格式
导入GaussView中发现自动在C上补了两个H，而且C原子的位置也发生了改变
我需要得到的是跟mol中坐标一样的结构，请问各位大侠，该如何操作？
mol文件不支持，内容如下：
1
  MatStudio         3D                             0

  3  0  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
    7.5000    7.5000    8.8078 Al  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0
    9.1069   10.5244    7.4999 Al  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0
    8.3034    9.0122    8.1539 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
M  END
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1楼 2015-04-15 10:03:07
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小范范1989

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangmt at 2015-04-15 16:44:44
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大师出手，果然不同凡响，涨姿势了又。
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
6楼2015-04-15 22:09:14
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kong890109

金虫 (小有名气)
原子这么少，直接在gaussview里画吧。
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2楼2015-04-15 14:13:16
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小范范1989

木虫 (著名写手)
对，直接用高斯view中画不就行吗？我记得gview画自由基保存出来的，没有自动加H。你试试
赞一下 回复此楼
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
3楼2015-04-15 14:54:05
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-04-15 14:54:05
对，直接用高斯view中画不就行吗？我记得gview画自由基保存出来的，没有自动加H。你试试

直接画是可以
可我这是通过CALYPSO软件搜索的，想继续往下算性质的
CALYPSO默认导出的就是cif文件，我是通过MS转换为mol，再导入GaussView的
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4楼2015-04-15 14:59:49
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