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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » GaussView打开不饱和结构自动加氢
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

[求助] GaussView打开不饱和结构自动加氢 已有1人参与

MS里构建的不饱和结构，Al2C，导出为mol格式
导入GaussView中发现自动在C上补了两个H，而且C原子的位置也发生了改变
我需要得到的是跟mol中坐标一样的结构，请问各位大侠，该如何操作？
mol文件不支持，内容如下：
1
  MatStudio         3D                             0

  3  0  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
    7.5000    7.5000    8.8078 Al  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0
    9.1069   10.5244    7.4999 Al  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0
    8.3034    9.0122    8.1539 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
M  END
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1楼 2015-04-15 10:03:07
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小范范1989

木虫 (著名写手)
对，直接用高斯view中画不就行吗？我记得gview画自由基保存出来的，没有自动加H。你试试
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
3楼2015-04-15 14:54:05
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kong890109

金虫 (小有名气)
原子这么少，直接在gaussview里画吧。
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2楼2015-04-15 14:13:16
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-04-15 14:54:05
对，直接用高斯view中画不就行吗？我记得gview画自由基保存出来的，没有自动加H。你试试

直接画是可以
可我这是通过CALYPSO软件搜索的，想继续往下算性质的
CALYPSO默认导出的就是cif文件，我是通过MS转换为mol，再导入GaussView的
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4楼2015-04-15 14:59:49
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xujc1983: 金币+40, ★★★★★最佳答案, 谢谢帮助，以前确实没有注意到这里还有个options 2015-04-15 17:00:06
gmy1990: 金币+1, 谢谢交流 2015-04-15 19:16:15
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GaussView打开不饱和结构自动加氢
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小范范1989
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
5楼2015-04-15 16:44:44
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普通表情 龙 兔 虎 猫
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