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混合配搭

新虫 (小有名气)

[交流] RACE后是单链的cDNA吗?

RACE后测得的序列是单链的cDNA吗?要是单链的话。可以用单链的序列BLAST,从而进行分析吗?刚接触,希望有好心的大神讲解一下哦。
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hailunl

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
11楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-04-16 11:12:58
可是,它是以CDNA为模版,怎么变成双链的啊?
...

无论是5‘还是3’RACE都是以cDNA为模板,迅速向一端合成,它涉及到rTaq,即以cDNA为模板,合成了双链的DNA,万变万变不离其宗都是DNA拓扑异构酶的原理。
如果你实在不懂,看看朱玉贤分子生物学,或者看看clontech的RACE说明书。
17楼2015-04-16 18:29:16
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mlbiosci

新虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-04-15 22:07:34
Race后也是基于反转录,以cdna为模板pcr得到的序列测序
2楼2015-04-15 00:20:37
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混合配搭

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mlbiosci at 2015-04-15 00:20:37
Race后也是基于反转录,以cdna为模板pcr得到的序列测序

哦,那就是说扩增出来的就是Cdna 的全长呗。
3楼2015-04-15 07:53:44
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mlbiosci

新虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
混合配搭: 金币+2 2015-04-15 13:51:31
引用回帖:
3楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-04-15 07:53:44
哦,那就是说扩增出来的就是Cdna 的全长呗。...

不见得是全长,看你从哪个地方开始进行,最少也是5“  3“ 两个部分,分别测序后序列组装

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2015-04-15 08:44:32
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