| 查看: 1079 | 回复: 2 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
雪狼乖乖
|
[交流]
【chemoffice】Chem3D格式使用心得
|
||
|
这是一个三维分子结构演示软件，上面有和Gaussian的链接，可以直接从 Chem3D打开Gaussian运算，本身也带有分子力场计算功能，还可以和Mopac 链接 可以打开的文件主要有以下几种： *.gjf,*.fch,*.cub,这几种是Gaussian的输入、formcheck和cube文件 *.dat,*.mop,*.mpc,mopac的输入文件 *.zmt,这个是内坐标格式的分子构型文件，和HyperChem、mopac通用 *.pdb,*.ent,Protein DB格式，和HyperChem、AlChem等等通用，Gaussian 本身也可以用这两种格式来生成内坐标文件 *.mol,MDL的mol格式，和HyperChem稍微有点不兼容，但是如果用AlChem打开 在保存一下（仍然是*.mol），Chem3D和HyperChem都可以打开了 最有用的可能是*.zmt,*.mol,*.gjf,*.fch四种格式 比如用Gaussian优化以后，在Ultilities选项里面选formcheck，就可以吧 check文件*.chk转化成*.fch，而*.fch是可以直接用Chem3D打开的 *.zmt是一内坐标的分子结构文件，我这里有个小软件可以把这种格式的文件 转换成*.gjf，是Gaussian的分子内坐标文件，但没有route section等等 Chem3D除了生成Gaussian输入文件以外，还有许多不错的功能 比如可以手动地转动某一个键，可以用鼠标显示某个键长，键角和二面角等 地大小，等等，还可以显示所以内坐标 显示也有各种模型方式，比如球棍、stick等等，可以显示原子编号原子名称 但是没有GaussView和HyperChem以及AlChem，WinMopac等等漂亮 （大家觉得好就顶一下）:cool: |
回复此楼» 猜你喜欢
【修正版】单环用磁约束低速电子实验方案（简化版）
已经有0人回复
-
桂林理工大学物理学专业招收调剂，还有三个名额！！！
已经有22人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有299人回复
-
考博自荐
已经有4人回复
-
山东大学第二批博士研究生招生
已经有0人回复
-
中国科学院东莞材料科学与技术研究所-2026年博士招生-吴昊研究员-磁学与自旋电子学
已经有0人回复
-
《电磁学》教材推荐
已经有1人回复
-
【急招】合肥工大核聚变材料计算方向2026级工程博士生
已经有4人回复
-
大豆异黄酮分离
已经有0人回复
-
湖南大学材料学院急招2026年博士生，临时增加一名博士联培指标
已经有10人回复
-
天津理工大学晶体材料全国重点实验室刘红军教授课题组招收博士生1-2名
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
mfshun1013
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 6307.9
- 散金: 1071
- 红花: 8
- 帖子: 1399
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 465555
- 注册: 2007-11-22
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
2楼2008-07-18 14:53:58
3楼2008-08-15 21:06:16
20