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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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ariesmz

铜虫 (小有名气)

[求助] 如果系统发育树所有的bootstrap几乎都是100(除了一个为99),说明什么问题? 已有1人参与

审稿中遇到一棵树,都是一个属的真菌做的一棵树,上面一共10个菌株,bootstrap几乎都是100(除了一个为99),说明什么问题?从没遇到过此类情况可能吗?
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ariesmz(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-04-13 19:39:12
说明作者挑选的序列相似性很高,这些菌亲缘关系比较接近。可能是作者那目标序列去blast,然后挑选相似性最高的做进化树。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2015-04-13 12:50:37
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ariesmz

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2015-04-13 12:50:37
说明作者挑选的序列相似性很高,这些菌亲缘关系比较接近。可能是作者那目标序列去blast,然后挑选相似性最高的做进化树。

谢谢!那么说这样也是可以的了?
3楼2015-04-13 14:11:18
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ariesmz at 2015-04-13 14:11:18
谢谢!那么说这样也是可以的了?...

我觉得作者的结果应该没有什么问题,这样的确可以说明目标物种属于某个属。但我建议构建进化树时要同时带上一些其他属的物种,这样一方面能说明物种归入某个属,另一方面也说明物种不归入其他属,这样一正一反更能说明问题。这里的作者只呈现了其中一个方面内容。
4楼2015-04-13 15:25:59
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