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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)

[交流] 请问,测序好坏怎么判断啊?

我想问一下,测序结果好坏应该怎么判断啊,是看测序图吗?
还有哪一个测序公司比较好呢?价格适中的。谢谢了!
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fengyue0116

铜虫 (正式写手)

根据测序图可以做大概的判断,
我是在上海生工测的,感觉还不错啊
2楼2008-07-03 17:28:08
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

南骏的也不错,便宜而且很快
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2008-07-03 17:42:41
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taishuai2004

当然是看AB1文件的峰形了,一般锐利的,没有交叉的,比较准确
峰形也与使用的测序仪有关,ABI的高低差不多,而贝克曼的高低上也有差异
个人认为TAKARA的测序结果最好,尤其是对复杂的模板,100元每反应
INVITROGEN  也不错,60元每反应。其它国内的一般40每反应,但测序质量一般。
4楼2008-07-03 18:57:26
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)

谢谢大家!
请问大家想要确定一个序列,需要测几个克隆啊?(我都是摇了菌送测序的)
几个克隆的测序结果差异大吗?
一般有几个碱基不一样啊?有没有某个碱基不能确定的时候啊?
比如说某各位点A和G的频率相等。我用的是TAKARA的普通Taq。
5楼2008-07-04 14:46:49
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)

没有人回答了啊,周末都休息了吗?
自己回复一下,否则找不到帖子了。
6楼2008-07-05 21:02:31
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)

请各位给点建议吧,
是酶还是测序的问题,还是序列的问题,
如果是序列的问题,说明是什么问题呢?
帮帮忙吧。
7楼2008-07-07 08:37:37
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liuyan6817

你碰到差异和大的情况吗?如果真有,酶的问题的可能性比较大
8楼2008-07-07 09:04:50
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seahow

木虫 (著名写手)

你只需要测一个克隆。 和酶的质量无关。 如果你觉得有突变,你在测一个克隆,或者重新pcr一遍,如果还是如此,那么她就是突变。 
9楼2008-07-07 09:28:40
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seahow

木虫 (著名写手)

另外,测序公司差不多,takara贵,(还是日本!!!)。 另外,国内第一家是赛百胜公司,后来生工 后来居上; 其他,如 英俊, 三博,等等, 全部来自于生工。 所以,我觉得 质量和生工一致,, 实践也如此。 你可以试试。。。
10楼2008-07-07 09:31:46
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