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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 请问，测序好坏怎么判断啊？
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)

[交流] 请问，测序好坏怎么判断啊？

我想问一下，测序结果好坏应该怎么判断啊，是看测序图吗？
还有哪一个测序公司比较好呢？价格适中的。谢谢了！
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1楼 2008-07-03 17:22:00
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fengyue0116

铜虫 (正式写手)
根据测序图可以做大概的判断，
我是在上海生工测的，感觉还不错啊
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2楼2008-07-03 17:28:08
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
南骏的也不错，便宜而且很快
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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2008-07-03 17:42:41
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taishuai2004

当然是看AB1文件的峰形了，一般锐利的，没有交叉的，比较准确
峰形也与使用的测序仪有关，ABI的高低差不多，而贝克曼的高低上也有差异
个人认为TAKARA的测序结果最好，尤其是对复杂的模板，100元每反应
INVITROGEN  也不错，60元每反应。其它国内的一般40每反应，但测序质量一般。
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4楼2008-07-03 18:57:26
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)
谢谢大家！
请问大家想要确定一个序列，需要测几个克隆啊？（我都是摇了菌送测序的）
几个克隆的测序结果差异大吗？
一般有几个碱基不一样啊？有没有某个碱基不能确定的时候啊？
比如说某各位点A和G的频率相等。我用的是TAKARA的普通Taq。
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5楼2008-07-04 14:46:49
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)
没有人回答了啊，周末都休息了吗？
自己回复一下，否则找不到帖子了。
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6楼2008-07-05 21:02:31
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)
请各位给点建议吧，
是酶还是测序的问题，还是序列的问题，
如果是序列的问题，说明是什么问题呢？
帮帮忙吧。
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7楼2008-07-07 08:37:37
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liuyan6817

你碰到差异和大的情况吗？如果真有，酶的问题的可能性比较大
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8楼2008-07-07 09:04:50
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seahow

木虫 (著名写手)
你只需要测一个克隆。　和酶的质量无关。　如果你觉得有突变，你在测一个克隆，或者重新ｐｃｒ一遍，如果还是如此，那么她就是突变。　
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9楼2008-07-07 09:28:40
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seahow

木虫 (著名写手)
另外，测序公司差不多，ｔａｋａｒａ贵，（还是日本！！！）。　另外，国内第一家是赛百胜公司，后来生工　后来居上；　其他，如　英俊，　三博，等等，　全部来自于生工。　所以，我觉得　质量和生工一致，，　实践也如此。　你可以试试。。。
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10楼2008-07-07 09:31:46
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