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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 带负电的基团（H3SiO-）计算时总变成（H3Si=O）
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bingmeng1987

木虫 (正式写手)

[求助] 带负电的基团（H3SiO-）计算时总变成（H3Si=O） 已有1人参与

我在用Gaussian 09软件计算带负电的基团（H3SiO-）与水分子间的相互作用时，带负电的基团（H3SiO-）总变成（H3Si=O），我在计算时本来想氧原子上有3对孤对电子，表现带负电，可是画好的分子结构在计算时变成了Si原子和O原子间形成了双键。这个双键对我的计算有影响吗？我不想孤电子对变成双键该怎么设置呢？我是一名新手，请大家多多帮助，谢谢！！！
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1楼 2015-04-13 00:22:07
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bingmeng1987

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2015-04-13 09:42:07
这是显然会有影响的，如果算成Si=O这样的模式，程序认定负电荷分布到整个分子上了，这和O带负点（也就是说负电荷主要集中在O上）是不一样的。
解决的办法是引入具有高杂化的密度泛函方法（看G09教程），其次可以换 ...

我设置为 6-3G*基组，可以认为引入了具有高杂化的高密度泛函吗？
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3楼2015-04-13 13:11:05
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
bingmeng1987: 金币+6, ★★★★★最佳答案 2015-04-13 13:10:19
bingmeng1987: 金币+4 2015-04-13 13:10:23
gmy1990: 金币+2, 谢谢交流 2015-04-14 05:20:14
这是显然会有影响的，如果算成Si=O这样的模式，程序认定负电荷分布到整个分子上了，这和O带负点（也就是说负电荷主要集中在O上）是不一样的。
解决的办法是引入具有高杂化的密度泛函方法（看G09教程），其次可以换软件，换那种可以在原子上设定电荷的软件。
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
2楼2015-04-13 09:42:07
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
引用回帖:
3楼: Originally posted by bingmeng1987 at 2015-04-13 13:11:05
我设置为 6-3G*基组，可以认为引入了具有高杂化的高密度泛函吗？...

方法，你这是基组。

[ 发自小木虫客户端 ]
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
4楼2015-04-13 14:03:51
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