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bingmeng1987

木虫 (正式写手)

[求助] 带负电的基团(H3SiO-)计算时总变成(H3Si=O) 已有1人参与

我在用Gaussian 09软件计算带负电的基团(H3SiO-)与水分子间的相互作用时,带负电的基团(H3SiO-)总变成(H3Si=O),我在计算时本来想氧原子上有3对孤对电子,表现带负电,可是画好的分子结构在计算时变成了Si原子和O原子间形成了双键。这个双键对我的计算有影响吗?我不想孤电子对变成双键该怎么设置呢?我是一名新手,请大家多多帮助,谢谢!!!
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
bingmeng1987: 金币+6, ★★★★★最佳答案 2015-04-13 13:10:19
bingmeng1987: 金币+4 2015-04-13 13:10:23
gmy1990: 金币+2, 谢谢交流 2015-04-14 05:20:14
这是显然会有影响的,如果算成Si=O这样的模式,程序认定负电荷分布到整个分子上了,这和O带负点(也就是说负电荷主要集中在O上)是不一样的。
解决的办法是引入具有高杂化的密度泛函方法(看G09教程),其次可以换软件,换那种可以在原子上设定电荷的软件。
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
2楼2015-04-13 09:42:07
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bingmeng1987

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2015-04-13 09:42:07
这是显然会有影响的,如果算成Si=O这样的模式,程序认定负电荷分布到整个分子上了,这和O带负点(也就是说负电荷主要集中在O上)是不一样的。
解决的办法是引入具有高杂化的密度泛函方法(看G09教程),其次可以换 ...

我设置为 6-3G*基组,可以认为引入了具有高杂化的高密度泛函吗?
3楼2015-04-13 13:11:05
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

引用回帖:
3楼: Originally posted by bingmeng1987 at 2015-04-13 13:11:05
我设置为 6-3G*基组,可以认为引入了具有高杂化的高密度泛函吗?...

方法,你这是基组。

[ 发自小木虫客户端 ]
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
4楼2015-04-13 14:03:51
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