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[交流] 《读懂天然产物》系列-17-宿主与寄生菌的“爱情保养”-"小三"你走开 已有1人参与

     《读懂天然产物系列》淘帖链接:http://muchong.com/bbs/taotie.php?action=view&ttid=55868欢迎各位虫友前往阅读、订阅!

       动植物内生菌与宿主之间的“互利互惠”(爱情故事)关系已逐渐为大家熟悉,关于这方面的报道也越来越多,本次评述重点介绍两篇关于内生菌与宿主如何维护这种生生世世的“恋情”的文章:
       [1] Jarrod J. Scott, Dong-Chan Oh, M. Cetin Yuceer, Kier D. Klepzig, Jon Clardy, Cameron R. Currie. Bacterial Protection of Beetle-Fungus Mutualism [J], Science, 2008, 322: 63.
        [2] Dong-Chan Oh, Michael Poulsen, Cameron R Currie, Jon Clardy, Dentigerumycin: a bacterial mediator of an ant-fungus symbiosis [J], Nature Chemical Biology, 2009, 5: 391-393.

        这两篇文章均是由Harvard Medical School与University of Wisconsin-Madison的两位Jon Clardy 和Cameron R Currie合作完成,这两个实验室分别致力于“how small molecules control biological processes” 和 “the symbiotic associations between animals and microbes” 的研究,关于这两位大牛的文章有很多,大家如有感兴趣的地方可以进一步查找。


第一篇文章:
《读懂天然产物》系列-17-宿主与寄生菌的“爱情保养”-"小三"你走开
引入:
     根据前期的文献调研发现,南方松树甲虫Dendroctonus frontalis与其共生真菌Entomocorticium sp. A在过着幸福生活的时候容易被“小三”竞争性真菌Ophiostoma minus抑制,从而破坏它们之间的“完美爱情”。作者通过电镜扫描(SEM)发现在南方松树甲虫的贮菌器(mycangium)中存在大量的放线菌,进而推测这些放线菌是保卫它们“爱情”的关键。
文中的主角关系如图一所示:

《读懂天然产物》系列-17-宿主与寄生菌的“爱情保养”-"小三"你走开-1


正文:
       作者从110个甲虫群采集分离得到846个放线菌菌落,从中选择了164 个菌落转接到纯培养基中,通过观察以及DNA序列分析证实外观上主要分为“红色”与“白色”两种,进一步通过symbiont pairing bioassays实验发现红色外形的菌落提取物可以抑制“小三”拮抗菌 Ophiostoma minus, 而对正常共生菌Entomocorticium sp. A仅有轻微的影响,接下来通过分离提取、结构鉴定得到化合物mycangimycin,化合物mycangimycin的结构解析发表在Org Lett. 2009, 11(3):633-636 (附件中文献[3])。实验流程如图二所示:
《读懂天然产物》系列-17-宿主与寄生菌的“爱情保养”-"小三"你走开-2
       作者得到纯化合物mycangimycin后,通过实验对之前的推测进行验证,发现mycangimycin对“小三”Ophiostoma minus ( MIC= 1.0 μM)的杀伤力接近是正常共生真菌Entomocorticium sp. A( MIC= 19.0 μM)的20倍! 此外,化合物mycangimycin对其他的一些真菌也具有较强的杀伤力,如图三所示:

《读懂天然产物》系列-17-宿主与寄生菌的“爱情保养”-"小三"你走开-3



第二篇文章:
《读懂天然产物》系列-17-宿主与寄生菌的“爱情保养”-"小三"你走开-4
引入:
       第二篇文章的整体思路与第一篇类似,其研究对象由“南方松树甲虫-真菌”共生系统变为“蚂蚁-真菌”共生系统, “蚂蚁-放线菌”共生系统一直是倍受关注的共生系统,具有以下三个特点:(1).进化的多样性使的“蚂蚁-放线菌”共生的蚂蚁种类有超过230种,提供了一个多分支的进化体系;(2).不同环境“蚂蚁-真菌”共生系统中的真菌种类多样,包括Basidiomycota, Agaricales: Lepiotaceae and Pterulaceae;(3).前期研究表明蚂蚁共生的Pseudonocardia spp.可以选择性的产生抗生素来抑制特定的入侵寄生真菌Escovopsis spp.但是尚未有文献对这些抗生素的具体结构进行报道。

正文:
(1) 活性追踪: 运用LC-MS从 Pseudonocardia spp菌株发酵液提取物中发现一个主要成分,进一步活性追踪分离得到化合物dentigerumycin。
(2) 结构确定: 结合1H, 13C NMR gCOSY, TOCSY, gHSQC 和gHMBC NMR确定该化合物的平面结构,根据ROESY确定其相对构型,dentigerumycin的绝对构型是这篇文章的重点描述的内容,从结构中来看dentigerumycin包括7个结构片段:2个piperazic acid 片段,1个γ-OH-Pip,1个丙氨酸Ala,1个N-OH-Ala,1个β-OH-Leu以及一个Acyl side chain。其中Pip-1, Pip-2, Ala和β-OH-Leu中的手性中心直接通过Marfey试剂来判断,N-OH-Ala通过化学转化为N-H-Ala也可以通过Marfey试剂判断其绝对构型(具体方法请参考附件中文献[4]);γ-OH-Pip通过Mosher试剂确定7位的绝对构型为7S,Acyl side chain上的邻二醇手性中心(29, 30)作者采用醋酸钼诱导的激子手性法来确定,进一步通过相对构型来判断33, 34位的绝对构型为33S, 34R.

《读懂天然产物》系列-17-宿主与寄生菌的“爱情保养”-"小三"你走开-5


(3) 活性验证:由于化合物dentigerumycin是通过活性追踪得到的,因此此对dentigerumycin的抑菌活性进行验证,实验表明dentigerumycin对入侵寄生真菌Escovopsis spp.的杀伤力为MIC= 2.8 μM,而对正常寄生真菌的杀伤力较弱;与此同时对野生型Candida albicans ATCC10231 和对两性霉素耐药的Candida albicans ATCC200955 具有较强的抑制作用(MIC = 1.1μM)。

《读懂天然产物》系列-17-宿主与寄生菌的“爱情保养”-"小三"你走开-6



讨论:
1. 如果有一天"小三"对爱情守护者"的“武器“-抗生产耐受性,宿主和共生菌这对伴侣肯定会寻找新的"抗生素"来维护这段爱情,在超级细菌问题日益严重的今天,那我们是否可以运用这个模型来筛选对抗超级细菌的化合物呢?

《读懂天然产物》系列-17-宿主与寄生菌的“爱情保养”-"小三"你走开-7


2. 第一篇文章是2008年发表的,2009年作者把第一篇文章里的mycangimycin结构解析部分单独发表在OL上,大家觉得这是一稿多投吗?

以上即为本人对这两篇文献的简单看法,相关文献请见附件!由于专业的局限性,一定有很多不足,请各位虫友见谅,并提出宝贵意见,谢谢!

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