24小时热门版块排行榜    

查看: 132  |  回复: 2
当前主题已经存档。

jissrain

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于amber 里好像是加氢出错的

我是一个新手
在做参数的时候
saveamberparm   prmtop文件和inpcrd文件  
时check的两个错误
第一个是总电荷不为零
(这个我也不会解决)
第二个如下
FATAL:  Atom  .R.A does not have a type
FATAL:  Atom  .R.A does not have a type
FATAL:  Atom  .R.A does not have a type
FATAL:  Atom  .R.A does not have a type
FATAL:  Atom  .R.A does not have a type
………………………………
出错的全部是ASP和 LYS
分别是H13 13  和H23 23
个人觉得是不是说氢的类型不对啊
可是我的pdb是没有氢的 xleap应该是自己加的啊
希望大家可以帮助我 万分感谢
新手上路 金币不多 聊表感谢
回复此楼
对不起,我不是个好孩子
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jissrain

金虫 (小有名气)

写错了 电荷不是整数 已经加入中和离子了
对不起,我不是个好孩子
2楼2008-07-03 08:52:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tecpenguin

铁虫 (初入文坛)


jissrain(金币+1,VIP+0):谢谢 是系统的错误
换个工具试试
苦干巧干,多动脑筋,坚持原则,掌握灵活,宽以待人,严于律己,广交朋友,不要吝啬
3楼2008-07-03 17:18:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jissrain 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见