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youmufeng

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Gromacs 的并行计算

我RedHat Enterprise LInux4.6 下安装 Gromacs3.3.3

我的电脑配置是两个双核cpu,系统显示有四个cpu

安装完成后提示可以进行并行计算。
计算过程中运行了:
lamboot  成功。
最后执行:
mdrunmdrun_mpi -np 4 -s ...gro .......-g md.log

也能工作,可是怎么系统显示的还是一个cpu在运行,而又三个cpu 闲置呢?

希望大家帮帮忙....
期待中...
谢谢....!
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suny2005

木虫 (小有名气)

请问lamboot 运行成功应该有何显示?
4楼2008-07-14 14:48:41
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查看全部 7 个回答

panda_wendao

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
youmufeng(金币+4,VIP+0):谢谢提示,问题已解决。
命令大概是这样的:
grompp -np 4 -f xx -c xx -o xx
mpirun -np 4 mdrun_mpi xxxx
2楼2008-07-02 22:22:45
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youmufeng

铁虫 (小有名气)

嗯,思路差不多...
谢谢....!
3楼2008-07-03 08:26:10
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jlz3278

金虫 (小有名气)

是啊,有什么显示吗?
5楼2008-07-20 08:28:51
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