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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【求助】Gromacs 的并行计算
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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youmufeng

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Gromacs 的并行计算

我RedHat Enterprise LInux4.6 下安装 Gromacs3.3.3

我的电脑配置是两个双核cpu，系统显示有四个cpu

安装完成后提示可以进行并行计算。
计算过程中运行了：
lamboot  成功。
最后执行：
mdrunmdrun_mpi -np 4 -s ...gro .......-g md.log

也能工作，可是怎么系统显示的还是一个cpu在运行，而又三个cpu 闲置呢？

希望大家帮帮忙....
期待中...
谢谢....!
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1楼 2008-07-02 21:58:27
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panda_wendao

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
youmufeng(金币+4,VIP+0):谢谢提示，问题已解决。
命令大概是这样的：
grompp -np 4 -f xx -c xx -o xx
mpirun -np 4 mdrun_mpi xxxx
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2楼2008-07-02 22:22:45
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youmufeng

铁虫 (小有名气)
嗯，思路差不多...
谢谢....!
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3楼2008-07-03 08:26:10
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suny2005

木虫 (小有名气)
请问lamboot 运行成功应该有何显示？
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4楼2008-07-14 14:48:41
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jlz3278

金虫 (小有名气)
是啊，有什么显示吗？
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5楼2008-07-20 08:28:51
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luai071

木虫 (著名写手)
应该是mpirun吧
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6楼2008-07-20 08:56:35
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qiaobf

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
引用回帖:
Originally posted by suny2005 at 2008-7-14 14:48:
请问lamboot 运行成功应该有何显示？

[a@b ~]$  lamboot

LAM 7.1.4/MPI 2 C++/ROMIO - Indiana University
赞一下(10人) 回复此楼
7楼2008-07-25 16:22:46
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