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计算化学新人

铜虫 (小有名气)

[求助] openmpi编译求助 已有2人参与

CXX      otfaux.o
/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(49): error: identifier "__ATOMIC_ACQ_REL"                                                                              is undefined
    { return __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
                                              ^

/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(49): error: identifier "__atomic_fetch_ad                                                                             d" is undefined
    { return __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
             ^

/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(53): error: identifier "__ATOMIC_ACQ_REL"                                                                              is undefined
    { __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
                                       ^

/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(53): error: identifier "__atomic_fetch_ad                                                                             d" is undefined
    { __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
      ^

compilation aborted for otfaux.cpp (code 2)
make[9]: *** [otfaux.o] 错误 2
make[9]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf/tools/                                                                             otfaux”
make[8]: *** [all-recursive] 错误 1
make[8]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf/tools”
make[7]: *** [all-recursive] 错误 1
make[7]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf”
make[6]: *** [all] 错误 2
make[6]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf”
make[5]: *** [all-recursive] 错误 1
make[5]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib”
make[4]: *** [all-recursive] 错误 1
make[4]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt”
make[3]: *** [all] 错误 2
make[3]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt”
make[2]: *** [all-recursive] 错误 1
make[2]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt”
make[1]: *** [all-recursive] 错误 1
make[1]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi”
make: *** [all-recursive] 错误 1

在此之前用了./configure CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort
然后用了make，最后出来以上错误
不知道应该怎么去解决，求大神们助攻！
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1楼 2015-04-08 20:43:21
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计算化学新人

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by KalaShayminS at 2015-04-09 20:05:26
可以不用，编译时指定编译器即可。不过我觉得还是直接用gcc/gfortran编译而不是intel，或者想办法下个新版intel编译器比较省事。...

指定，怎么指定啊？
网上教程都是intel，自己不懂这个，只能跟着网上走啊
我的11版都是好不容易求到的啊。。。。。。
赞一下 回复此楼
12楼2015-04-10 10:50:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
ljw4010: 金币+1, 谢谢交流！ 2015-04-08 22:42:11
intel编译器版本和gcc编译器版本分别是多少？疑似是两个版本差了太多导致的不兼容。
赞一下 回复此楼
2楼2015-04-08 20:49:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

白菜胡萝卜

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-04-09 07:50:34
用GCC 和gfortran编译就不出错。至于为啥我现在也没搞清楚。另外，楼主是root安装的么？感觉也有可能是权限问题
赞一下 回复此楼
3楼2015-04-09 04:24:58
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计算化学新人

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by KalaShayminS at 2015-04-08 20:49:35
intel编译器版本和gcc编译器版本分别是多少？疑似是两个版本差了太多导致的不兼容。

你好，我的gcc是4.8.2，icc是2011，请问这俩不兼容吗？如果是，应该怎么办？
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4楼2015-04-09 08:38:44
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