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1楼 2015-04-01 20:19:48

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smilesir

银虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

permutation目的是breaking the linkage between the genotype and phenotype，方法是用随机的基因型去和表型关联，每一次permutation取max(LOD)，共1000次。然后取第95%的值做你的threshold。

你的threshold高一方面你应该相信他，可能threshold真的就是那么高；另一方面需要调整你的模型。

另外，你指的LOD高是和什么比较起来高？你如果用bonferroni对threshold矫正, 结果是多少？

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2楼2015-07-03 22:11:00

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FTT1205

新虫 (初入文坛)

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专业: 植物遗传学

引用回帖:

2楼: Originally posted by smilesir at 2015-07-03 22:11:00
permutation目的是breaking the linkage between the genotype and phenotype，方法是用随机的基因型去和表型关联，每一次permutation取max(LOD)，共1000次。然后取第95%的值做你的threshold。

你的threshold高 ...

那么请问LOD达到一百多了是怎么回事呢

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3楼2019-09-29 16:02:08

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