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suny2005

木虫 (小有名气)

[交流] [求助]力场参数中如何constraint键

文献中给出了这部分参数
bonds         req (Å            Kr (kJ mol-1 Å-2)
CR/W-HA    1.08             (constrained)
C*-H* b        1.09            (constrained)
我要如何在itp文件中表示这部分内容呢?看了manaul中的相关内容,没有理解。还请大家指教!
我在itp文件中的【bonds】部分后加上
[ constrainttypes ]
   2     3      2    1.08
   5     6      2    1.08
   7     8      2    1.08
   9    10      2    1.09
   9    11      2    1.09
  12    13      2    1.09
  12    14      2    1.09
  15    16      2    1.09
  15    17      2    1.09
  18    19      2    1.09
这样理解对不对呢?
还有funct类型中的2指的是什么意思?type 1 is used for generating exclusions and type 2 is not?是不是在定以了2之后就不用添加其他部分了?

[ Last edited by suny2005 on 2008-7-1 at 10:40 ]
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qiaobf


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
就我的理解,对化学键constraints的function type 应该是1,而不是2。参看手册5.3.5 Exclusions部分
3楼2008-07-25 17:01:22
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