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suny2005

木虫 (小有名气)

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[交流] [求助]力场参数中如何constraint键

文献中给出了这部分参数
bonds req (Å

         Kr (kJ mol-1 Å-2)
CR/W-HA 1.08          (constrained)
C*-H* b       1.09          (constrained)
我要如何在itp文件中表示这部分内容呢？看了manaul中的相关内容，没有理解。还请大家指教！
我在itp文件中的【bonds】部分后加上
[ constrainttypes ]
2    3    2 1.08
5    6    2 1.08
7    8    2 1.08
9 10    2 1.09
9 11    2 1.09
  12 13    2 1.09
  12 14    2 1.09
  15 16    2 1.09
  15 17    2 1.09
  18 19    2 1.09
这样理解对不对呢？
还有funct类型中的2指的是什么意思？type 1 is used for generating exclusions and type 2 is not？是不是在定以了2之后就不用添加其他部分了？

[ Last edited by suny2005 on 2008-7-1 at 10:40 ]

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