24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1384  |  回复: 2

baichangming

银虫 (小有名气)

[求助] 求SNP/indel Calling的软件 已有1人参与

发现网上很多SNP/indel Calling的软件都是针对第二代测序技术数据设计的,但是我现在有3个公开发表的基因组,均已装配好,相分析他们的snp和indel,有什么软件推荐呢?
最好还能取分编码和非编码区的功能。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nanhu1984

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
Mauve就可以分析SNP
https://www.microbialgenomic.cn/
2楼2015-03-28 16:37:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baichangming

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2015-03-28 16:37:37
Mauve就可以分析SNP

是的,不过只能给出一个简单地数量,没有indel的结果
3楼2015-03-29 19:01:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 baichangming 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 321求调剂 +4 认真求上学 2026-04-03 4/200 2026-04-04 11:02 by rzh123456
[考研] 387求调剂 +4 爱吃片豆土 2026-04-03 5/250 2026-04-04 08:10 by 岸上的一条鱼
[考研] 319求调剂 +3 星星不眨眼喽 2026-04-03 3/150 2026-04-03 21:45 by zhq0425
[考研] 11408 359分 求调剂 +4 yfever 2026-03-28 4/200 2026-04-03 16:43 by asdfzly
[考研] 一志愿华北电力大学(北京),材料科学与工程学硕265,求调剂 +9 yelck 2026-04-03 10/500 2026-04-03 13:20 by yelck
[考研] 274求调剂 +10 薛定谔的虎。 2026-04-01 10/500 2026-04-03 10:13 by tianyyysss
[考研] 330分求调剂 +15 qzenlc 2026-03-29 15/750 2026-04-02 21:41 by 百灵童888
[考研] 求调剂求调剂 +7 121. 2026-04-02 7/350 2026-04-02 19:15 by dick_runner
[考研] 275学硕081000服从调剂到其他专业,保不住本专业了 +7 一只小小水牛 2026-04-02 8/400 2026-04-02 14:23 by alice-2022
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +3 cs0106 2026-04-02 5/250 2026-04-02 11:37 by olim
[考研] 07生物学求调剂 一志愿同济大学359分 +3 LAMC. 2026-03-30 3/150 2026-04-02 10:26 by 18828373951
[考研] 337求调剂 +11 《树》 2026-03-29 11/550 2026-04-02 10:20 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿安徽大学计算机科学与技术学硕,331分求调剂 +5 蒋昌鹏qtj 2026-04-01 5/250 2026-04-02 08:10 by fxue1114
[考博] 26年申博 +3 staryer 2026-03-30 4/200 2026-04-01 23:21 by ai4pharm
[考研] 265求调剂 +11 yelck 2026-04-01 12/600 2026-04-01 19:12 by 549790059
[考研] 086000生物与医药 初试274求调剂 +5 小叮当来了 2026-03-30 6/300 2026-04-01 14:25 by mxj1203
[考研] 085600,321分求调剂 +13 大馋小子 2026-03-31 13/650 2026-04-01 12:35 by chemdavid
[考研] 318求调剂 +8 七忆77 2026-04-01 8/400 2026-04-01 10:37 by Jaylen.
[考研] 080500-315分复试调剂 +9 上岸3821 2026-03-31 9/450 2026-03-31 17:29 by 唐沐儿
[考研] 抱歉 +3 田洪有 2026-03-30 3/150 2026-03-30 19:11 by 迷糊CCPs
信息提示
请填处理意见