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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 建立QSAR的Descriptors应该如何选择？
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zhad33

铜虫 (初入文坛)

[求助] 建立QSAR的Descriptors应该如何选择？ 已有3人参与

如题，另外，QSAR的建立方法应该怎么选？Descriptors和Model是各种都试一下，看用哪种方法建立的结果比较好？还是根据自己的分子情况选的，如果这样，应该怎么选择？
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stayrealkids~
1楼 2015-03-26 10:52:25
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小小鸟飞啊飞

铜虫 (正式写手)
你好，我也是做QSPR这方面的，求交流
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5楼2016-06-03 21:27:58
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cych0815

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以把Descriptors和分类方法各种都试一下，看用哪种方法建立的结果比较好，也可以利用F-test或则t-test的P-value值来判断descriptors与label标签的相关性，再选择descriptors进行建模
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2楼2015-03-27 08:51:32
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超人与小木虫

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhad33: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-04-28 14:38:15
建立QSAR的方法很多，如SVM、KNN、RF、DT和NB等等，如果是以QSAR为主题发表论文，我建议每个流行的方法都应当尝试，单个方法想发一篇好文章很困难。至于描述子选择，可以先删除都是常量的描述子，如都为1，0等；再次考察变量间的相关性，依据相关系数删除相关性高的变量；也可通过建立回归方程，考察目标变量与自变量间的相关性，选择保留相关性高的变量即可。变量选择方法很多，QSAR文章应该都有提到。我个人认为QSAR应该首选线性算法，这样易于模型解释；在对结果影响不大的模型基础上，减少描述子，越少越好，易于机理的解释。
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超人不会飞
3楼2015-04-01 10:26:59
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cavediger

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

1.所有参数一起上，利用逐步回归搜索好的组合
2.用遗传算法筛选变量
3.用遗传程序设计，自动选择变量和模型
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我们都老得太快，却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅，蓦然发现，本来就有一条笔直的路，直达山顶....
4楼2015-04-01 17:10:25
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