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zhad33

铜虫 (初入文坛)

[求助] 建立QSAR的Descriptors应该如何选择? 已有3人参与

如题,另外,QSAR的建立方法应该怎么选?Descriptors和Model是各种都试一下,看用哪种方法建立的结果比较好?还是根据自己的分子情况选的,如果这样,应该怎么选择?
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stayrealkids~
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cych0815

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以把Descriptors和分类方法各种都试一下,看用哪种方法建立的结果比较好,也可以利用F-test或则t-test的P-value值来判断descriptors与label标签的相关性,再选择descriptors进行建模
2楼2015-03-27 08:51:32
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超人与小木虫

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhad33: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-04-28 14:38:15
建立QSAR的方法很多,如SVM、KNN、RF、DT和NB等等,如果是以QSAR为主题发表论文,我建议每个流行的方法都应当尝试,单个方法想发一篇好文章很困难。至于描述子选择,可以先删除都是常量的描述子,如都为1,0等;再次考察变量间的相关性,依据相关系数删除相关性高的变量;也可通过建立回归方程,考察目标变量与自变量间的相关性,选择保留相关性高的变量即可。变量选择方法很多,QSAR文章应该都有提到。我个人认为QSAR应该首选线性算法,这样易于模型解释;在对结果影响不大的模型基础上,减少描述子,越少越好,易于机理的解释。
超人不会飞
3楼2015-04-01 10:26:59
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cavediger

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

1.所有参数一起上,利用逐步回归搜索好的组合
2.用遗传算法筛选变量
3.用遗传程序设计,自动选择变量和模型
我们都老得太快,却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅,蓦然发现,本来就有一条笔直的路,直达山顶....
4楼2015-04-01 17:10:25
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小小鸟飞啊飞

铜虫 (正式写手)

你好,我也是做QSPR这方面的,求交流
5楼2016-06-03 21:27:58
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