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建立QSAR的Descriptors应该如何选择? 已有3人参与
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| 如题,另外,QSAR的建立方法应该怎么选?Descriptors和Model是各种都试一下,看用哪种方法建立的结果比较好?还是根据自己的分子情况选的,如果这样,应该怎么选择? |
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2楼2015-03-27 08:51:32
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhad33: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-04-28 14:38:15
zhad33: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-04-28 14:38:15
| 建立QSAR的方法很多,如SVM、KNN、RF、DT和NB等等,如果是以QSAR为主题发表论文,我建议每个流行的方法都应当尝试,单个方法想发一篇好文章很困难。至于描述子选择,可以先删除都是常量的描述子,如都为1,0等;再次考察变量间的相关性,依据相关系数删除相关性高的变量;也可通过建立回归方程,考察目标变量与自变量间的相关性,选择保留相关性高的变量即可。变量选择方法很多,QSAR文章应该都有提到。我个人认为QSAR应该首选线性算法,这样易于模型解释;在对结果影响不大的模型基础上,减少描述子,越少越好,易于机理的解释。 |

3楼2015-04-01 10:26:59

4楼2015-04-01 17:10:25
5楼2016-06-03 21:27:58










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