应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 关于cube文件格式及电荷密度或查分电荷密度
131/1返回列表
查看: 1442  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

xixi1007

木虫 (小有名气)

[交流] 关于cube文件格式及电荷密度或查分电荷密度

我用cubegen产生NMA分子的cube文件，如下所示。请问1-4行代表什么啊。后面的12行应该是原子坐标吧。再后面的6列数据（后面还有数据）就是电荷密度吗？
opt+freq density
Electron density from Total SCF Density
   12   -9.978578   -7.531114   -6.512787
  102    0.200587    0.000000    0.000000
   76    0.000000    0.200587    0.000000
   66    0.000000    0.000000    0.200587
    6    6.000000   -3.465826   -1.018362    0.000068
    1    1.000000   -3.337918   -3.084344   -0.000119
    1    1.000000   -4.529803   -0.412610   -1.667526
    1    1.000000   -4.529544   -0.412881    1.667928
    6    6.000000   -0.913373    0.302129   -0.000035
    8    8.000000   -0.724982    2.617096   -0.000009
    7    7.000000    1.162647   -1.229627   -0.000270
    1    1.000000    0.928214   -3.122590    0.000476
    6    6.000000    3.714089   -0.198064    0.000103
    1    1.000000    5.061188   -1.763049   -0.002254
    1    1.000000    4.029210    0.977837   -1.673448
    1    1.000000    4.030640    0.974042    1.676089
  5.17508E-09  6.28142E-09  7.57083E-09  9.06127E-09  1.07699E-08  1.27125E-08
  1.49026E-08  1.73514E-08  2.00662E-08  2.30506E-08  2.63034E-08  2.98184E-08
  3.35839E-08  3.75823E-08  4.17903E-08  4.61788E-08  5.07134E-08  5.53544E-08
  6.00579E-08  6.47758E-08  6.94576E-08  7.40504E-08  7.85003E-08  8.27535E-08
  8.67570E-08  9.04598E-08  9.38140E-08  9.67754E-08  9.93043E-08  1.01367E-07
  1.02934E-07  1.03986E-07  1.04507E-07  1.04490E-07  1.03936E-07  1.02852E-07
  1.01252E-07  9.91600E-08  9.66032E-08  9.36162E-08  9.02390E-08  8.65160E-08
  8.24954E-08  7.82285E-08  7.37682E-08  6.91683E-08  6.44829E-08  5.97644E-08
  5.50635E-08  5.04279E-08  4.59014E-08  4.15231E-08  3.73274E-08  3.33429E-08
  2.95926E-08  2.60936E-08  2.28573E-08  1.98897E-08  1.71916E-08  1.47592E-08
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2015-03-26 10:49:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2015-03-26 19:59:28
1-4行代表cube的规格。第一行的后三位是cube的xyz坐标的起始点，2-4行是xyz的格点数目、步长。
后面的12行是原子坐标。
再后面的6列数据就是电荷密度的值，按上面cube的规格逐一格点给出的值，仅值，不必给出坐标值。
详见高斯手册。
赞一下 回复此楼
13楼2015-03-26 15:10:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
shcj2楼
2015-03-26 10:57   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
dmbb3楼
2015-03-26 10:57   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
kiss200855374楼
2015-03-26 10:59   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
假大空5楼
2015-03-26 11:06   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
nono20096楼
2015-03-26 11:06   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
qqaoqq7楼
2015-03-26 11:12   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
messengermu8楼
2015-03-26 11:26   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
sz_kebaoyuan9楼
2015-03-26 13:41   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
xiaomaya204610楼
2015-03-26 13:48   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
tingting198211楼
2015-03-26 13:49   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
小木鸭12楼
2015-03-26 13:50   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 xixi1007 的主题更新
131/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +19 羊腰板 2026-08-21 22/1100 2026-08-25 10:38 by popular289
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +17 kkkl_v 2026-08-19 18/900 2026-08-25 09:41 by windflowerwy
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +7 scalable 2026-08-24 7/350 2026-08-24 23:01 by anata1209
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤？
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 科研孤儿太难了 +18 我4大白菜 2026-08-20 19/950 2026-08-24 09:47 by 凯恩广盛催化分�
[基金申请] 什么时候开奖？ +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭