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xixi1007

木虫 (小有名气)

[交流] 关于cube文件格式及电荷密度或查分电荷密度

我用cubegen产生NMA分子的cube文件，如下所示。请问1-4行代表什么啊。后面的12行应该是原子坐标吧。再后面的6列数据（后面还有数据）就是电荷密度吗？
opt+freq density
Electron density from Total SCF Density
   12   -9.978578   -7.531114   -6.512787
  102    0.200587    0.000000    0.000000
   76    0.000000    0.200587    0.000000
   66    0.000000    0.000000    0.200587
    6    6.000000   -3.465826   -1.018362    0.000068
    1    1.000000   -3.337918   -3.084344   -0.000119
    1    1.000000   -4.529803   -0.412610   -1.667526
    1    1.000000   -4.529544   -0.412881    1.667928
    6    6.000000   -0.913373    0.302129   -0.000035
    8    8.000000   -0.724982    2.617096   -0.000009
    7    7.000000    1.162647   -1.229627   -0.000270
    1    1.000000    0.928214   -3.122590    0.000476
    6    6.000000    3.714089   -0.198064    0.000103
    1    1.000000    5.061188   -1.763049   -0.002254
    1    1.000000    4.029210    0.977837   -1.673448
    1    1.000000    4.030640    0.974042    1.676089
  5.17508E-09  6.28142E-09  7.57083E-09  9.06127E-09  1.07699E-08  1.27125E-08
  1.49026E-08  1.73514E-08  2.00662E-08  2.30506E-08  2.63034E-08  2.98184E-08
  3.35839E-08  3.75823E-08  4.17903E-08  4.61788E-08  5.07134E-08  5.53544E-08
  6.00579E-08  6.47758E-08  6.94576E-08  7.40504E-08  7.85003E-08  8.27535E-08
  8.67570E-08  9.04598E-08  9.38140E-08  9.67754E-08  9.93043E-08  1.01367E-07
  1.02934E-07  1.03986E-07  1.04507E-07  1.04490E-07  1.03936E-07  1.02852E-07
  1.01252E-07  9.91600E-08  9.66032E-08  9.36162E-08  9.02390E-08  8.65160E-08
  8.24954E-08  7.82285E-08  7.37682E-08  6.91683E-08  6.44829E-08  5.97644E-08
  5.50635E-08  5.04279E-08  4.59014E-08  4.15231E-08  3.73274E-08  3.33429E-08
  2.95926E-08  2.60936E-08  2.28573E-08  1.98897E-08  1.71916E-08  1.47592E-08
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1楼 2015-03-26 10:49:06
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zhou2009

版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2015-03-26 19:59:28
1-4行代表cube的规格。第一行的后三位是cube的xyz坐标的起始点，2-4行是xyz的格点数目、步长。
后面的12行是原子坐标。
再后面的6列数据就是电荷密度的值，按上面cube的规格逐一格点给出的值，仅值，不必给出坐标值。
详见高斯手册。
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13楼2015-03-26 15:10:44
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shcj2楼
2015-03-26 10:57   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
dmbb3楼
2015-03-26 10:57   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
kiss200855374楼
2015-03-26 10:59   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
假大空5楼
2015-03-26 11:06   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
nono20096楼
2015-03-26 11:06   回复  
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qqaoqq7楼
2015-03-26 11:12   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
messengermu8楼
2015-03-26 11:26   回复  
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sz_kebaoyuan9楼
2015-03-26 13:41   回复  
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xiaomaya204610楼
2015-03-26 13:48   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
tingting198211楼
2015-03-26 13:49   回复  
xixi1007(金币+1): 谢谢参与
小木鸭12楼
2015-03-26 13:50   回复  
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