24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1151  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

黑木秋草

银虫 (小有名气)

[求助] 低水平计算优化出来的结构能用于高水平算法上进行NBO分析吗? 已有2人参与

用半经验PM3算法优化了一些复合物和单体,想直接在PM3优化输出的log文件里采用DFT // B31YP//6-311++G(d, p)
进行能量计算和NBO分析,结果主要是用来作对比和看复合前后的电荷变化。请问这样的对比结果可靠吗?看了很多讨论,还是不太清楚,跪求各位前辈大神们出手相助!!!!!
这是优化时的输入文件
%nprocshared=3
Will use up to    3 processors via shared memory.
%mem=600MB
%chk=D:\g09w\save\RACPM3.chk
---------------------------
# opt pm3 geom=connectivity
---------------------------
1/14=-1,18=20,19=15,26=1,38=1,57=2/1,3;
2/9=110,12=2,17=6,18=5,40=1/2;
--------------------------------------------------------------------------------------------------------
%mem=60MW                 这是采用优化后的log文件进行NBO分析的输入文件,这样输入会不会有问题?   
%nprocshared=3
Will use up to    3 processors via shared memory.
-------------------------------------------
# b3lyp/6-31+g(d) pop=nbo geom=connectivity
-------------------------------------------
1/38=1,57=2/1;
2/12=2,17=6,18=5,40=1/2;
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
黑木秋草: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-03-27 13:50:34
一般来说是可以这么做的。但是我的建议是用DFT在优化好的结构下再opt+freq一次,应该不会很慢。
结构优化了不再做个freq有点半途而废的感觉啊。。。
5楼2015-03-26 07:13:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有这样的用法

但是真没条件用dft优化吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-03-25 21:57:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑木秋草

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by qchem at 2015-03-25 21:57:22
有这样的用法

但是真没条件用dft优化吗?

单体只有7个,但复合物太多了,用的是个人电脑,实在是运行不过来。如果我采用DFT做NBO分析,不进一步进行DFT优化,这样结果做对比不会差太远吧?(不会意思,最近弄得有点神经质了,想确认一下,最好有先例呀)
3楼2015-03-25 22:06:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
黑木秋草: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-03-27 13:50:19
引用回帖:
3楼: Originally posted by 黑木秋草 at 2015-03-25 22:06:54
单体只有7个,但复合物太多了,用的是个人电脑,实在是运行不过来。如果我采用DFT做NBO分析,不进一步进行DFT优化,这样结果做对比不会差太远吧?(不会意思,最近弄得有点神经质了,想确认一下,最好有先例呀)...

主要怕审稿人觉得不OK让你补,就麻烦了

不然么对一些大的体系几何优化用半经验是完全可以的
先例前些年的肯定有

但现在计算条件好很多了,再这么做。。。。。
除非你证明这么做结果也一样可靠

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2015-03-26 05:36:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085601材料工程找调剂 +7 oatmealR 2026-03-29 7/350 2026-03-29 11:37 by fmesaito
[考研] 327求调剂 +4 汲亦昊 2026-03-29 4/200 2026-03-29 10:26 by wxiongid
[考研] 求调剂一志愿武汉理工大学材料工程(085601) +6 WW.' 2026-03-23 8/400 2026-03-29 09:41 by lbsjt
[考研] 298求调剂 +4 种圣赐 2026-03-28 4/200 2026-03-29 08:42 by q1092522407
[考研] 一志愿211 初试270分 求调剂 +8 谷雨上岸 2026-03-23 9/450 2026-03-29 01:00 by 我是小康
[考研] 数一英一271专硕(085401)求调剂,可跨 +7 前行必有光 2026-03-28 8/400 2026-03-28 23:22 by 小木虫tim
[考研] 求调剂 +7 争取九点睡 2026-03-28 8/400 2026-03-28 21:07 by 争取九点睡
[考研] 085404求调剂,总分309,本科经历较为丰富 +4 来财aa 2026-03-25 4/200 2026-03-28 07:41 by 棒棒球手
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +15 荷包蛋hyj 2026-03-26 15/750 2026-03-28 04:13 by fmesaito
[考研] 266分求材料化工冶金矿业等专业的调剂 +4 哇呼哼呼哼 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:02 by zhyzzh
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 8/400 2026-03-27 16:38 by 18419759900
[考研] 材料292调剂 +12 橘颂思美人 2026-03-23 12/600 2026-03-27 15:44 by caszguilin
[考研] 085600,材料与化工321分,求调剂 +9 大馋小子 2026-03-27 9/450 2026-03-27 14:30 by mmm just
[考研] 305求调剂 +5 哇卢卡库 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:01 by laoshidan
[考研] 324求调剂 +8 hanamiko 2026-03-26 10/500 2026-03-27 08:06 by hypershenger
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 材料调剂 5+4 想要一壶桃花水 2026-03-25 10/500 2026-03-26 19:56 by 不吃魚的貓
[考研] 接收2026硕士调剂(学硕+专硕) +4 allen-yin 2026-03-23 6/300 2026-03-23 15:04 by 汪!?!
[考研] 070300,一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
信息提示
请填处理意见