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wr1915

新虫 (小有名气)

[求助] Schrodinger里phase模块DHHRR_9.xyz是什么文件,如何产生? 已有1人参与

如题,做药效团模拟的教程时,这个DHHRR_9.xyz是作为Hypothesis去搜库的,请问这个是什么文件,如何产生的?
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后觉

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wr1915 at 2015-03-20 10:29:05
谢谢,用药效团筛库的时候是会产生这样的文件。那我想请问一下生成的药效团如何提取出来,比如我需要用这个药效团去搜寻其他库的时候,怎样才能导入做好的药效团,不是***.xyz这个文件吗?...

选择文件夹,这样就可以导出药效团。。。
Schrodinger里phase模块DHHRR_9.xyz是什么文件,如何产生?
我没有做过高通量筛选
不过我是把整个保存成project文件,需要的时候再用Phase打开

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2015-03-21 10:09:09
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查看全部 5 个回答

后觉

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wr1915(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2015-03-20 08:02:10
wr1915: 金币+48, ★★★很有帮助 2015-03-20 10:25:32
这应该是生成药效团的子文件吧,只要生成药效团就有这样的文件,单独文件好像没什么作用
hypoID .xyz  Site coordinates for the given hypothesis. Stored in the
hypotheses subdirectory.
这是官方说明 就是生成药效团的子文件夹里的,保留着就好了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2015-03-19 20:47:17
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wr1915

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 后觉 at 2015-03-19 20:47:17
这应该是生成药效团的子文件吧,只要生成药效团就有这样的文件,单独文件好像没什么作用
hypoID .xyz  Site coordinates for the given hypothesis. Stored in the
hypotheses subdirectory.
这是官方说明 就是生 ...

谢谢,用药效团筛库的时候是会产生这样的文件。那我想请问一下生成的药效团如何提取出来,比如我需要用这个药效团去搜寻其他库的时候,怎样才能导入做好的药效团,不是***.xyz这个文件吗?
3楼2015-03-20 10:29:05
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wr1915

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 后觉 at 2015-03-21 10:09:09
选择文件夹,这样就可以导出药效团。。。

我没有做过高通量筛选
不过我是把整个保存成project文件,需要的时候再用Phase打开...

好的,谢谢,我试试。

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2015-03-21 15:40:43
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