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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » Schrodinger里phase模块DHHRR_9.xyz是什么文件，如何产生？
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wr1915

新虫 (小有名气)

[求助] Schrodinger里phase模块DHHRR_9.xyz是什么文件，如何产生？ 已有1人参与

如题，做药效团模拟的教程时，这个DHHRR_9.xyz是作为Hypothesis去搜库的，请问这个是什么文件，如何产生的？
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1楼 2015-03-19 11:41:25
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后觉

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wr1915(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2015-03-20 08:02:10
wr1915: 金币+48, ★★★很有帮助 2015-03-20 10:25:32
这应该是生成药效团的子文件吧，只要生成药效团就有这样的文件，单独文件好像没什么作用
hypoID .xyz  Site coordinates for the given hypothesis. Stored in the
hypotheses subdirectory.
这是官方说明 就是生成药效团的子文件夹里的，保留着就好了
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wr1915
2楼2015-03-19 20:47:17
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wr1915

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 后觉 at 2015-03-19 20:47:17
这应该是生成药效团的子文件吧，只要生成药效团就有这样的文件，单独文件好像没什么作用
hypoID .xyz  Site coordinates for the given hypothesis. Stored in the
hypotheses subdirectory.
这是官方说明 就是生 ...

谢谢，用药效团筛库的时候是会产生这样的文件。那我想请问一下生成的药效团如何提取出来，比如我需要用这个药效团去搜寻其他库的时候，怎样才能导入做好的药效团，不是***.xyz这个文件吗？
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3楼2015-03-20 10:29:05
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后觉

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wr1915 at 2015-03-20 10:29:05
谢谢，用药效团筛库的时候是会产生这样的文件。那我想请问一下生成的药效团如何提取出来，比如我需要用这个药效团去搜寻其他库的时候，怎样才能导入做好的药效团，不是***.xyz这个文件吗？...

选择文件夹，这样就可以导出药效团。。。
Schrodinger里phase模块DHHRR_9.xyz是什么文件，如何产生？
我没有做过高通量筛选
不过我是把整个保存成project文件，需要的时候再用Phase打开
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wr1915
4楼2015-03-21 10:09:09
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wr1915

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 后觉 at 2015-03-21 10:09:09
选择文件夹，这样就可以导出药效团。。。

我没有做过高通量筛选
不过我是把整个保存成project文件，需要的时候再用Phase打开...

好的，谢谢，我试试。

[ 发自小木虫客户端 ]
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5楼2015-03-21 15:40:43
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