应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » Schrodinger里phase模块DHHRR_9.xyz是什么文件，如何产生？
51/1返回列表
查看: 925  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wr1915

新虫 (小有名气)

[求助] Schrodinger里phase模块DHHRR_9.xyz是什么文件，如何产生？ 已有1人参与

如题，做药效团模拟的教程时，这个DHHRR_9.xyz是作为Hypothesis去搜库的，请问这个是什么文件，如何产生的？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-03-19 11:41:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

后觉

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wr1915(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2015-03-20 08:02:10
wr1915: 金币+48, ★★★很有帮助 2015-03-20 10:25:32
这应该是生成药效团的子文件吧，只要生成药效团就有这样的文件，单独文件好像没什么作用
hypoID .xyz  Site coordinates for the given hypothesis. Stored in the
hypotheses subdirectory.
这是官方说明 就是生成药效团的子文件夹里的，保留着就好了
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

wr1915
2楼2015-03-19 20:47:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wr1915

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 后觉 at 2015-03-19 20:47:17
这应该是生成药效团的子文件吧，只要生成药效团就有这样的文件，单独文件好像没什么作用
hypoID .xyz  Site coordinates for the given hypothesis. Stored in the
hypotheses subdirectory.
这是官方说明 就是生 ...

谢谢，用药效团筛库的时候是会产生这样的文件。那我想请问一下生成的药效团如何提取出来，比如我需要用这个药效团去搜寻其他库的时候，怎样才能导入做好的药效团，不是***.xyz这个文件吗？
赞一下 回复此楼
3楼2015-03-20 10:29:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

后觉

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wr1915 at 2015-03-20 10:29:05
谢谢，用药效团筛库的时候是会产生这样的文件。那我想请问一下生成的药效团如何提取出来，比如我需要用这个药效团去搜寻其他库的时候，怎样才能导入做好的药效团，不是***.xyz这个文件吗？...

选择文件夹，这样就可以导出药效团。。。
Schrodinger里phase模块DHHRR_9.xyz是什么文件，如何产生？
我没有做过高通量筛选
不过我是把整个保存成project文件，需要的时候再用Phase打开
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

wr1915
4楼2015-03-21 10:09:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wr1915

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 后觉 at 2015-03-21 10:09:09
选择文件夹，这样就可以导出药效团。。。

我没有做过高通量筛选
不过我是把整个保存成project文件，需要的时候再用Phase打开...

好的，谢谢，我试试。

[ 发自小木虫客户端 ]
回复此楼
5楼2015-03-21 15:40:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wr1915 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +6 德尚中行 2026-08-27 7/350 2026-08-30 12:53 by Bxndjjd
[基金申请] 国社科又开始会评了，不知道这次命运如何 +3 雨打竹帘 2026-08-30 4/200 2026-08-30 12:35 by 白大多亮
[考博] 找导师 +5 yuanjiabao 2026-08-29 6/300 2026-08-30 11:52 by zhouyanli11
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +8 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:40 by l0VvVHGBGRLv
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:19 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 29号明天会评吗 +3 笨笨唐 2026-08-28 3/150 2026-08-30 09:29 by cww8181
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 08:33 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:39 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:28 by ZPa0EcMwuECS
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 11/550 2026-08-30 05:40 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:58 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 01:03 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +4 tannykie 2026-08-29 4/200 2026-08-29 17:14 by lmz0216
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭