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ritchiejin

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请教论坛里各位专家关于做多肽的de novo测序遇到的问题?已有1人参与

本人初学生物质谱,本单位的设备是Bruker的maXis ESI-Q-TOF。这段时间我一直在做合成多肽的de novo测序,遇到了一些问题,希望专家和虫友们帮忙!
(1)我已经知道合成多肽的理论序列,想通过二级质谱进行测序,之前做的是无修饰氨基酸序列,利用配套软件就完成了。现在手里的样品每个氨基酸都有复杂的修饰,我能仅靠手动去识别 y 离子 质量差来确定被修饰的氨基酸么?
(2)我得到的二级质谱150m/z 以下的峰没有(扫描范围是50~2000m/z),我尝试把collision energy调高一些,只是在150~200m/z的碎片信号强了一些。导致现在两端两个氨基酸无法得到碎片信息。我该怎么办?
(3)样品单电荷峰为1631.7522,带两个电荷的峰为816.3778,在做全谱扫描时,双电荷峰很强(100%),但是单电荷峰只有(0.25%),根本看不到,能调整么?
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MHSW

禁言 (正式写手)

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2楼2015-09-23 16:56:35
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