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ritchiejin

铜虫 (初入文坛)

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[求助] 请教论坛里各位专家关于做多肽的de novo测序遇到的问题？已有1人参与

本人初学生物质谱，本单位的设备是Bruker的maXis ESI-Q-TOF。这段时间我一直在做合成多肽的de novo测序，遇到了一些问题，希望专家和虫友们帮忙！
（1）我已经知道合成多肽的理论序列，想通过二级质谱进行测序，之前做的是无修饰氨基酸序列，利用配套软件就完成了。现在手里的样品每个氨基酸都有复杂的修饰，我能仅靠手动去识别 y 离子质量差来确定被修饰的氨基酸么？
（2）我得到的二级质谱150m/z 以下的峰没有（扫描范围是50~2000m/z），我尝试把collision energy调高一些，只是在150~200m/z的碎片信号强了一些。导致现在两端两个氨基酸无法得到碎片信息。我该怎么办？
（3）样品单电荷峰为1631.7522，带两个电荷的峰为816.3778，在做全谱扫描时，双电荷峰很强（100%），但是单电荷峰只有（0.25%），根本看不到，能调整么？

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