应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » Discovery Studio 2.5中需要UniRef90数据库，怎样对其进行下载和安装？
101/1返回列表
查看: 3764  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yaoxibaga

铁虫 (小有名气)

[求助] Discovery Studio 2.5中需要UniRef90数据库，怎样对其进行下载和安装？ 已有2人参与

Discovery Studio 2.5中需要UniRef90数据库，怎样对其进行下载和安装？敬请各位的帮助，万分感谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

首医药化

» 猜你喜欢
nevergivenup
1楼 2015-03-12 15:53:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ftp://ftp.uniprot.org/pub/databa ... 0/uniref90.fasta.gz
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2015-03-12 19:04:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jmcookie

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2015-03-12 19:04:16
ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/uniref/uniref90/uniref90.fasta.gz

你好，我想请问下这个数据库怎么安装的？
赞一下 回复此楼
3楼2015-03-20 15:43:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jmcookie

金虫 (小有名气)
你好，我想请问下这个数据库怎么安装到Discovery Studio 2.5的？
赞一下 回复此楼
4楼2015-03-20 15:43:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lengyuewuhen

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jmcookie at 2015-03-20 15:43:50
你好，我想请问下这个数据库怎么安装到Discovery Studio 2.5的？

战友，您好！请问数据库安装到DS软件下，这个问题您是否已解决？最近小辈也遇到了同样的一个难题，望指教，不胜感激！
赞一下 回复此楼
迷途的我将要何去何从
5楼2015-11-10 22:54:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jmcookie

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by lengyuewuhen at 2015-11-10 22:54:39
战友，您好！请问数据库安装到DS软件下，这个问题您是否已解决？最近小辈也遇到了同样的一个难题，望指教，不胜感激！...

我的已解决，其实你把数据库做好之后，如果你知道DS中存放数据库的文件夹的话，直接把你的数据库拷贝过去就行，然后重启DS就能看见了，如果不知道，你可在DS安装文件夹下搜索PDB-nr95（DS本身自带的数据库）这个文件，也能找到DS存放数据库的文件夹，相对来说还是比较容易的！
赞一下 回复此楼
6楼2015-11-11 09:46:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lengyuewuhen

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jmcookie at 2015-11-11 09:46:07
我的已解决，其实你把数据库做好之后，如果你知道DS中存放数据库的文件夹的话，直接把你的数据库拷贝过去就行，然后重启DS就能看见了，如果不知道，你可在DS安装文件夹下搜索PDB-nr95（DS本身自带的数据库）这个文 ...

感谢前辈耐心解答！晚辈按照您的指示，搜索找到了PDB＿nr95所在目录，发现数据库中都是罕见的文件格式，.phr, .pin, .psi等，而我下载的都是.pdb蛋白，请问这个数据库如何建立？望赐教，拜谢～

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
迷途的我将要何去何从
7楼2015-11-11 20:13:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lengyuewuhen

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jmcookie at 2015-11-11 09:46:07
我的已解决，其实你把数据库做好之后，如果你知道DS中存放数据库的文件夹的话，直接把你的数据库拷贝过去就行，然后重启DS就能看见了，如果不知道，你可在DS安装文件夹下搜索PDB-nr95（DS本身自带的数据库）这个文 ...

前辈，您好！晚辈按照您的指示搜索找到了PDB-nr95所在路径，发现都是一些陌生格式的文件，而我从NCBI上下载的是.pdb文件，请问如何建立蛋白数据库才能被软件识别？恳请您不吝赐教，晚辈万分感激~
赞一下 回复此楼
迷途的我将要何去何从
8楼2015-11-13 18:44:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jmcookie

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by lengyuewuhen at 2015-11-13 18:44:35
前辈，您好！晚辈按照您的指示搜索找到了PDB-nr95所在路径，发现都是一些陌生格式的文件，而我从NCBI上下载的是.pdb文件，请问如何建立蛋白数据库才能被软件识别？恳请您不吝赐教，晚辈万分感激~...

其实你还没有建库，这个在NCBI里面下载formatdb程序，然后将你的pdb文件转化成DS能够识别的.phr, .pin, .psi等文件格式的数据库文件，具体过程你问问度娘就知道了，也不是很难！
赞一下 回复此楼
9楼2015-11-13 19:43:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

钟有奇

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by jmcookie at 2015-11-13 19:43:35
其实你还没有建库，这个在NCBI里面下载formatdb程序，然后将你的pdb文件转化成DS能够识别的.phr, .pin, .psi等文件格式的数据库文件，具体过程你问问度娘就知道了，也不是很难！...

前辈好，我是用2楼的链接下载的，然后解压得到uniref90.fasta；又下载了blast。用formatdb.exe格式化数据库，但总提示“could not open uniref90.fasta ”还请前辈指点
赞一下 回复此楼
10楼2015-12-24 09:44:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yaoxibaga 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 4/200 2026-11-11 06:57 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:32 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 7/350 2026-11-11 04:21 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:10 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:07 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 03:59 by Z7qfCsdIiD1T
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:54 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-11 01:24 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:21 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:10 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:02 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-10 20:45 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-10 20:12 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 申请环境，微生物方向博士 +3 浅笑09 2026-11-08 3/150 2026-11-10 12:44 by 可淡不可忘
[考博] 27博士申请 +3 白白白ly 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:39 by szq0819
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 08:00 by IhnEQauGmT3K
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭