应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » Discovery Studio 2.5中需要UniRef90数据库，怎样对其进行下载和安装？
101/1返回列表
查看: 3471  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yaoxibaga

铁虫 (小有名气)

[求助] Discovery Studio 2.5中需要UniRef90数据库，怎样对其进行下载和安装？ 已有2人参与

Discovery Studio 2.5中需要UniRef90数据库，怎样对其进行下载和安装？敬请各位的帮助，万分感谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

首医药化

» 猜你喜欢
nevergivenup
1楼 2015-03-12 15:53:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ftp://ftp.uniprot.org/pub/databa ... 0/uniref90.fasta.gz
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2015-03-12 19:04:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jmcookie

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2015-03-12 19:04:16
ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/uniref/uniref90/uniref90.fasta.gz

你好，我想请问下这个数据库怎么安装的？
赞一下 回复此楼
3楼2015-03-20 15:43:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jmcookie

金虫 (小有名气)
你好，我想请问下这个数据库怎么安装到Discovery Studio 2.5的？
赞一下 回复此楼
4楼2015-03-20 15:43:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lengyuewuhen

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jmcookie at 2015-03-20 15:43:50
你好，我想请问下这个数据库怎么安装到Discovery Studio 2.5的？

战友，您好！请问数据库安装到DS软件下，这个问题您是否已解决？最近小辈也遇到了同样的一个难题，望指教，不胜感激！
赞一下 回复此楼
迷途的我将要何去何从
5楼2015-11-10 22:54:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jmcookie

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by lengyuewuhen at 2015-11-10 22:54:39
战友，您好！请问数据库安装到DS软件下，这个问题您是否已解决？最近小辈也遇到了同样的一个难题，望指教，不胜感激！...

我的已解决，其实你把数据库做好之后，如果你知道DS中存放数据库的文件夹的话，直接把你的数据库拷贝过去就行，然后重启DS就能看见了，如果不知道，你可在DS安装文件夹下搜索PDB-nr95（DS本身自带的数据库）这个文件，也能找到DS存放数据库的文件夹，相对来说还是比较容易的！
赞一下 回复此楼
6楼2015-11-11 09:46:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lengyuewuhen

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jmcookie at 2015-11-11 09:46:07
我的已解决，其实你把数据库做好之后，如果你知道DS中存放数据库的文件夹的话，直接把你的数据库拷贝过去就行，然后重启DS就能看见了，如果不知道，你可在DS安装文件夹下搜索PDB-nr95（DS本身自带的数据库）这个文 ...

感谢前辈耐心解答！晚辈按照您的指示，搜索找到了PDB＿nr95所在目录，发现数据库中都是罕见的文件格式，.phr, .pin, .psi等，而我下载的都是.pdb蛋白，请问这个数据库如何建立？望赐教，拜谢～

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
迷途的我将要何去何从
7楼2015-11-11 20:13:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lengyuewuhen

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jmcookie at 2015-11-11 09:46:07
我的已解决，其实你把数据库做好之后，如果你知道DS中存放数据库的文件夹的话，直接把你的数据库拷贝过去就行，然后重启DS就能看见了，如果不知道，你可在DS安装文件夹下搜索PDB-nr95（DS本身自带的数据库）这个文 ...

前辈，您好！晚辈按照您的指示搜索找到了PDB-nr95所在路径，发现都是一些陌生格式的文件，而我从NCBI上下载的是.pdb文件，请问如何建立蛋白数据库才能被软件识别？恳请您不吝赐教，晚辈万分感激~
赞一下 回复此楼
迷途的我将要何去何从
8楼2015-11-13 18:44:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jmcookie

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by lengyuewuhen at 2015-11-13 18:44:35
前辈，您好！晚辈按照您的指示搜索找到了PDB-nr95所在路径，发现都是一些陌生格式的文件，而我从NCBI上下载的是.pdb文件，请问如何建立蛋白数据库才能被软件识别？恳请您不吝赐教，晚辈万分感激~...

其实你还没有建库，这个在NCBI里面下载formatdb程序，然后将你的pdb文件转化成DS能够识别的.phr, .pin, .psi等文件格式的数据库文件，具体过程你问问度娘就知道了，也不是很难！
赞一下 回复此楼
9楼2015-11-13 19:43:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

钟有奇

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by jmcookie at 2015-11-13 19:43:35
其实你还没有建库，这个在NCBI里面下载formatdb程序，然后将你的pdb文件转化成DS能够识别的.phr, .pin, .psi等文件格式的数据库文件，具体过程你问问度娘就知道了，也不是很难！...

前辈好，我是用2楼的链接下载的，然后解压得到uniref90.fasta；又下载了blast。用formatdb.exe格式化数据库，但总提示“could not open uniref90.fasta ”还请前辈指点
赞一下 回复此楼
10楼2015-12-24 09:44:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yaoxibaga 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 考研化学学硕调剂，一志愿985 +3 张vvvv 2026-03-15 5/250 2026-03-16 20:25 by 张vvvv
[考研] 0703化学调剂 +6 妮妮ninicgb 2026-03-15 9/450 2026-03-16 16:40 by houyaoxu
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[基金申请] NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗 20+5 NSFC2026我来了 2026-03-10 14/700 2026-03-15 23:53 by 不负韶华的虎
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +6 zlingli 2026-03-13 6/300 2026-03-15 20:00 by ryzcf
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 311求调剂 +5 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:05 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +4 薛云鹏 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:40 by 学员8dgXkO
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
[考研] 279求调剂 +3 莫xiao 2026-03-10 4/200 2026-03-11 08:06 by 斩魂滴兔子！
[考研] 298求调剂 +3 Vv呀！ 2026-03-10 3/150 2026-03-10 22:40 by 剑诗杜康
[考研] 085602化工求调剂 +7 董boxing 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:07 by BruceLiu320
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭