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秸秆LXM

金虫 (小有名气)

[求助] 测序小RNA文库,鉴定植物病毒,用生物信息学如何分析 已有2人参与

小弟我把有植物病毒的花叶做了小RNA文库,公司没有帮我分析,现在需要分析是哪种病毒,小弟我没有接触过生物信息学,所以请高手指点一下,如何鉴定这个病毒
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做好自己,做自己想做的事情。
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gnot_nail

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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秸秆LXM(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-03-10 22:40:37
小RNA文库,不太了解,如果是大致鉴别这个病毒的话,可以试试把测序的序列拿去NCBI里blast,然后可以搜集相似性较高的多个不同物种序列,然后做进化树,就可以大致知道你的这个病毒处于哪种分类了。
6楼2015-03-10 12:18:32
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
没做基因组测序吗
你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
2楼2015-03-10 11:02:21
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

没有做基因组测序吗?你现在手里有什么数据?
你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
3楼2015-03-10 11:03:10
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秸秆LXM

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-03-10 11:03:10
没有做基因组测序吗?你现在手里有什么数据?

已经做了基因测序,还有做了小RNA文库
做好自己,做自己想做的事情。
4楼2015-03-10 11:33:42
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