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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 其他 » ★★★★★ 【有奖交流】免费计算软件爱好者~请进来集合~★★★★★
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lm_nudt

铁杆木虫 (著名写手)

再推荐两个

1、也是老汉的！
【名称】Accelrys公司推出免费的Discovery Studio Visualizer
【链接】http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=247121&fpage=21
2、计算器也算是软件吧
【名称】网络化学计算器大集
【链接】http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=283606&fpage=21
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21楼2008-06-22 15:42:21
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liverangel

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
csfn(金币+3,VIP+0):3q
数值计算（可以执行大部分matlab功能）octave
以及其出图软件(gnuplot) www.gnuplot.info

强大啊，
支持脚本文件
同时拥有linux版本和windows版本
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在明天到来之前不要放弃，想想你今天能干些什么？
22楼2008-06-24 11:03:12
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狼狼乾坤

铁杆木虫 (职业作家)

转帖的abinit简介

★ ★ ★ ★ ★
csfn(金币+5,VIP+0):3q
ABINIT
简介：ABINIT的主程序使用赝势和平面波，用密度泛函理论计算总能量，电荷密度，分子和周期性固体的电子结构，进行几何优化和分子动力学模拟，用TDDFT（对分子）或GW近似（多体微扰理论）计算激发态。此外还提供了大量的工具程序。程序的基组库包括了元素周期表1-109号所有元素。ABINIT适于固体物理，材料科学，化学和材料工程的研究，包括固体，分子，材料的表面，以及界面，如导体、半导体、绝缘体和金属。

功能：
可以计算很多物理属性：
A. 计算倒格子中核与电子的总能量。
A.1. 计算使用平面波和赝势。
A.2. 总能量的计算使用密度泛函理论（DFT）。可以使用大多数重要的局域密度近似 (LDA)，包括Perdew-Zunger近似。可以使用两种不同的局域自旋密度(LSD)，包括Perdew Wang 92和M. Teter的LSD。还可以使用Perdew-Burke-Ernzerhof，revPBE，RPBE和HCTH等GGA (自旋极化和非极化)。
A.3. 自恰场计算生成DFT基态，以及相关的能量和密度。此后的非自恰计算可以对能带结构的大量k-点产生本征能量。态密度的计算即可以用四面体方法，也可以用模糊技术。
A.4. 程序可以使用多种不同的赝势。对整个周期表适用的有两种：Troullier-Martins型和Goedecker型（这种类型包括自旋-轨道耦合）。如果需要的话，有四个代码可以产生新的赝势。
A.5. 程序本身可以处理金属和绝缘体系。
A.6. 晶胞可以是正交或者非正交。计算可以输入任何对称性及相应的k-点集。
A.7. 电子体系可以用自旋极化和自旋非极化计算。一个特殊的选项可以有效地处理反铁磁性。可以对总能量计算非共线的磁性（不能用于力，张量，相应函数...）。可以禁止晶胞的总磁矩。
A.8. 总能量，力，张量和电子结构的计算可以考虑自旋-轨道耦合。
A.9. 能量可分解为不同的成分（局域势，XC，Hartree...）。
A.10. 计算内部电子本征值。
A.11. 230个空间群和1191个Shubnikov磁群的对称性分析。
B. 计算总能量和本征能量
B.1. 用解析公式计算Hellman-Feynman力。
B.2. 计算应力。
B.3. 极化的计算。
B.4. 响应的计算。
B.5. 计算近似的和准确的磁化系数矩阵和介电矩阵。
B.6. 解析计算电子本征能量的导数。
B.7. 计算光学传导性。
B.8. Born有效电荷的能带分解，以及局域化张量的计算。
C. 激发态
C.1. 用GW近似计算电离能和亲和能。
C.2. 用TDDFT计算原子和分子的（单重、三重）激发态和振荡强度。
D. 移动原子，改变晶胞参数
D.1. 用不同的方法寻找平衡构型。可以同时优化晶胞参数。优化过程中如果需要的话，可以固定指定的晶胞参数，角度，或原子位置。
D.2. 有两种算法进行分子动力学计算。
D.3. 自动分析键长键角。原子坐标的格式支持用可视化软件XMOL显示。
E. 分析和图形工具
E.1. 后期处理程序cut3d用于分析密度和势文件。它还可以改变文件格式，提取2D明面或者1D线。此外还可以分析波函文件。
E.2. 另一个后期处理程序aim，用于进行Bader的“原子中的分子”（AIM）密度分析。
E.3. 对可视化程序产生格式化数据：键结构（用XMGR显示），不同参数的总能量（用XMGR显示），电荷密度（3D轮廓线，先用cut3d，再用商业程序matlab；cut3d也可以产生2D密度图）。
E.4. 后期处理程序band2eps自动画出eps格式的声子散射曲线。
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努力找方向！
23楼2008-07-01 08:16:10
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狼狼乾坤

铁杆木虫 (职业作家)

菜鸟安装abinit的经历~~（娱乐用）

★ ★ ★ ★ ★
csfn(金币+5,VIP+0):hehe，把你的安装补充完整呀 :-)
1、使用ubuntu系统，上来就装abinit，缺少n多东西，于是安装g95、blas、fftw、lapack等，安装g95时有出错提示：缺少C编译器。
2、于是装gcc，也安装不上，后经高人指点，安装完整版linux，使用镜像文件自带的gcc等，还自带了blas,lapack,fftw等。
3、安装好上述程序，开始安装abinit，是从debian的官网上下的，安装到make步骤的时候出错：tar:找不到一个路径下的lapack_pre_abinit3.2一类的提示，以为是lapack的原因，于是下载lapack安装，又出错，错误信息127，很多人有同样的错误，没解决。
4、再仔细看了下安装abinit时的出错信息，按提示找不到文件的路径查看了下，果然文件夹是空的（~~~！！）
5、从别处下载了abinit，解压后先看了上述路径，存在那个文件，于是安装这个abinit，安装成功。
6、从任意目录下输入abinis，提示说没有这个命令，郁闷，难道我没安装成功吗？
7、学习abinit官网上的tutorial1，人家说我这个安装情况要在abinit/src/main目录下输入abinis才好使，于是试了下，终于可以了……

虽然安装了，但是还有N多问题没解决，菜鸟还是一头雾水的，希望有大虾看到给予解答~~以下是未解决的问题：
1、linux挂载不上移动硬盘，插上移动硬盘后，挂载不上，盘还有“哒哒”的声音
2、为什么debian官网上下的abinit却少东西，安装出问题，是否我少下了什么东西？
3、安装lapck时有出错信息127
4、abinit的安装步骤：
./config/scripts/makemake
./configure
make
make install
是否我的安装步骤太简单了？所以不能在任意目录下运行abinit？只能在~/src/main下运行？

[ Last edited by 狼狼乾坤 on 2008-7-1 at 08:47 ]
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努力找方向！
24楼2008-07-01 08:43:32
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)
我觉得abinit、pwscf是不错的免费软件，二者均可以用于声子谱计算，
另外二者也各有别的功能。

abinit包含了GW近似计算，可以有效解决激发态、半导体能隙问题；
http://www.abinit.org/

pwscf可以计算强关联系数U、CPMD第一性原理分子动力学计算，并且将从头算分子动力学从中区分开。
http://www.pwscf.org/
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储氢家族欢迎储氢研究者！
25楼2008-07-09 14:03:39
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百合588

木虫 (正式写手)
看看先，
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26楼2008-07-15 09:06:29
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njiview

新虫 (初入文坛)
CPMD也是免费的
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27楼2008-07-16 22:21:41
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cxl1379

铁杆木虫 (小有名气)
推荐hyperchm  gaussian98或03  GaussView chemoffice这几款画图或计算软件
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28楼2008-07-24 09:03:52
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匿名

用户注销 (文坛精英)

KOP
本帖仅楼主可见
29楼2008-07-26 08:22:03
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zsma

木虫 (著名写手)

小木虫之二当家
是不是整理活动已经结束了啊，本来想毛遂自荐的，下次吧。

祝贵版越办越好
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绝没说是第一，更没有说是第二！
30楼2008-07-28 13:42:19
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