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csfn

荣誉版主 (知名作家)

优秀超版优秀版主优秀区长

[交流] ★★★★★ 【有奖交流】免费计算软件爱好者~请进来集合~★★★★★


一起支持发展免费(计算/辅助)软件~  


   免费(计算/辅助)软件由于经济或开源方面的优势,已经越来越受重视。版内许多虫子呼吁建立相关的分类。在此,我们先搞一个小活动,诚恳邀请广大计算爱好者介绍推广免费(计算/辅助)软件。希望您将您熟悉的,感兴趣的免费(计算/辅助)软件介绍给大家。希望越来越多的计算爱好者一起来推广优秀的软件,一起交流进步。

  您可以直接跟帖,或另外开帖介绍。形式字数不限。
  根据帖子详细度情况酌情奖励金币2-10枚







[ Last edited by csfn on 2008-8-17 at 16:28 ]
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狼狼乾坤

铁杆木虫 (职业作家)

转帖的abinit简介

★ ★ ★ ★ ★
csfn(金币+5,VIP+0):3q
ABINIT
简介:ABINIT的主程序使用赝势和平面波,用密度泛函理论计算总能量,电荷密度,分子和周期性固体的电子结构,进行几何优化和分子动力学模拟,用TDDFT(对分子)或GW近似(多体微扰理论)计算激发态。此外还提供了大量的工具程序。程序的基组库包括了元素周期表1-109号所有元素。ABINIT适于固体物理,材料科学,化学和材料工程的研究,包括固体,分子,材料的表面,以及界面,如导体、半导体、绝缘体和金属。

功能:
可以计算很多物理属性:
A. 计算倒格子中核与电子的总能量。
A.1. 计算使用平面波和赝势。
A.2. 总能量的计算使用密度泛函理论(DFT)。可以使用大多数重要的局域密度近似 (LDA),包括Perdew-Zunger近似。可以使用两种不同的局域自旋密度(LSD),包括Perdew Wang 92和M. Teter的LSD。还可以使用Perdew-Burke-Ernzerhof,revPBE,RPBE和HCTH等GGA (自旋极化和非极化)。
A.3. 自恰场计算生成DFT基态,以及相关的能量和密度。此后的非自恰计算可以对能带结构的大量k-点产生本征能量。态密度的计算即可以用四面体方法,也可以用模糊技术。
A.4. 程序可以使用多种不同的赝势。对整个周期表适用的有两种:Troullier-Martins型和Goedecker型(这种类型包括自旋-轨道耦合)。如果需要的话,有四个代码可以产生新的赝势。
A.5. 程序本身可以处理金属和绝缘体系。
A.6. 晶胞可以是正交或者非正交。计算可以输入任何对称性及相应的k-点集。
A.7. 电子体系可以用自旋极化和自旋非极化计算。一个特殊的选项可以有效地处理反铁磁性。可以对总能量计算非共线的磁性(不能用于力,张量,相应函数...)。可以禁止晶胞的总磁矩。
A.8. 总能量,力,张量和电子结构的计算可以考虑自旋-轨道耦合。
A.9. 能量可分解为不同的成分(局域势,XC,Hartree...)。
A.10. 计算内部电子本征值。
A.11. 230个空间群和1191个Shubnikov磁群的对称性分析。
B. 计算总能量和本征能量
B.1. 用解析公式计算Hellman-Feynman力。
B.2. 计算应力。
B.3. 极化的计算。
B.4. 响应的计算。
B.5. 计算近似的和准确的磁化系数矩阵和介电矩阵。
B.6. 解析计算电子本征能量的导数。
B.7. 计算光学传导性。
B.8. Born有效电荷的能带分解,以及局域化张量的计算。
C. 激发态
C.1. 用GW近似计算电离能和亲和能。
C.2. 用TDDFT计算原子和分子的(单重、三重)激发态和振荡强度。
D. 移动原子,改变晶胞参数
D.1. 用不同的方法寻找平衡构型。可以同时优化晶胞参数。优化过程中如果需要的话,可以固定指定的晶胞参数,角度,或原子位置。
D.2. 有两种算法进行分子动力学计算。
D.3. 自动分析键长键角。原子坐标的格式支持用可视化软件XMOL显示。
E. 分析和图形工具
E.1. 后期处理程序cut3d用于分析密度和势文件。它还可以改变文件格式,提取2D明面或者1D线。此外还可以分析波函文件。
E.2. 另一个后期处理程序aim,用于进行Bader的“原子中的分子”(AIM)密度分析。
E.3. 对可视化程序产生格式化数据:键结构(用XMGR显示),不同参数的总能量(用XMGR显示),电荷密度(3D轮廓线,先用cut3d,再用商业程序matlab;cut3d也可以产生2D密度图)。
E.4. 后期处理程序band2eps自动画出eps格式的声子散射曲线。
努力找方向!
23楼2008-07-01 08:16:10
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dnp

荣誉版主 (知名作家)

小木虫浪子

优秀版主

★ ★ ★ ★ ★
csfn(金币+5,VIP+0):小d说的大部分貌似收费软件~ 呵呵
哈哈,板凳,俺们推荐一下:
matlab,非常优良的一款计算软件,免费……

excel,origin,chemdraw,等虽然是画图,但作为一款计算的话,也不失为一个比较方便的工具,特别是对于不喜欢编程计算的而言。

fortran,曾经叱咤风云的计算语言,现在仍然有广阔的市场,虽然不是软件,但语言总得由软件实现,因此列于此。

数学方面的: maple,SPSS

另外数据挖掘的XLMiner等……

不多,等待补充
What would Jesus do?
2楼2008-06-18 22:14:01
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小曼

铁杆木虫 (文坛精英)

得瑟的玉米妞......


csfn(金币+1,VIP+0):有就快补充来^_^
o(∩_∩)o...,电脑里面装了不少软件,不过目前都还没有用着,还有的是在那里没有敢安装~~嘿嘿~~
偶滴新浪微博,欢迎加粉~~http://weibo.com/u/1874222543
3楼2008-06-18 22:15:28
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
csfn(金币+8,VIP+0):老汉信息简洁但精炼~
上面说的(ChemDraw, Origin, Excel, SPSS等等),没有一个是免费的。

老汉推荐:

(1)统计:R, SciLab
(2)二维结构、反应:ISIS/Draw, JME
(3)量化:NWChem
(4)分子力学、动力学:TINKER, NAMD, GROMACS
(5)格式转化:BABEL
(6)三维显示:Chime
(7)分子对接:ArgusLab,DOCK, AutoDOCK
(8)开发包:JChem, OEChem,PyMOL
(9)数据库:NMRShiftDB
(10)辅助工具:Jmol, GaussView, VMD, ADT....

[ Last edited by yalefield on 2008-6-18 at 22:33 ]
4楼2008-06-18 22:31:27
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