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wanglin2788860

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】哪位高手帮忙分析一下出错原因

至今还不太清楚怎么给应助者金币,版主辛苦一下帮忙代扣吧
出错信息如下:
Error: restraint create torsion: torsion subset cannot be created for all path specifications.
while executing
"restraint create my_restraint torsion "irb_high:1:C12" "irb_high:1:C11" "irb_high:1:C10" "irb_high:1:N1""

这是在对某药物分子进行conformational analysis 遇到的问题,目的是寻找local energy最小的分子构象,附图为定义的由以上四个原子组成的该torsion

[ Last edited by wanglin2788860 on 2008-6-23 at 08:51 ]
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xxffliu

铜虫 (小有名气)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
不能根据所选原子创建二面角,你用的是MS吗?有的软件指定二面角的时候要先指定两个根原子,就是可旋转键的那两个原子。
一点猜想,呵呵,可以试一下。
2楼2008-06-18 11:05:21
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wanglin2788860

银虫 (小有名气)

我用的就是ms啊,这个软件需要指定“根原子”么?如果需要的话该如何指定呢?
我完全是模仿help文件中教程Predicting a polymorphic form of a potential anti-cancer drug - conformational analysis 的做的,其中conformational analysis 是通过在tab文件中编写程序语句实现的,这段语句比较简单,我全部拷贝下来,只是把其中的分子名改变为我做的这个分子的名字,然后运行就出现了该出错信息。我仔细看了一遍没有发现指定“根原子”的语句。
3楼2008-06-18 12:08:58
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