应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请教虫虫们：我分配了50G的内存，gaussian报错……
51/1返回列表
查看: 922  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

一棵草12

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教虫虫们：我分配了50G的内存，gaussian报错…… 已有1人参与

用的是g09。这是我的报错信息：“Error termination via Lnk1e in /vol6/home/zksc-6/Gaussian/g09/l1002.exe at Fri Feb 13 14:44:16 2015.
Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC:
LenV=      976372 MaxCom=        -260”。这个是由于内存不足导致的么，我分配了50G的内存。
###########################################################
下面是我的输入文件：
%NProcShared=24
%mem=50GB
%chk=freq-b3.chk
#p freq b3lyp/6-31+g(d,p) nosymm

b3

0 1
O               -1   28.41519600   14.92430000   22.02840000
O                0   23.89602600   14.96598600   21.79038700
O               -1   25.79430000   14.92430000   14.15790000
O               -1   22.19440000   14.92430000   14.20070000
O               -1   25.79430100   14.92430000   27.54090000
O               -1   22.19439800   14.92430000   27.58370000
O               -1   15.78330000   14.92430000   19.29960000
O               -1   18.40422400   14.92430000   24.81210600
O               -1   19.94190000   16.85840000   23.98499900
Si              -1   28.48430100   16.46639900   22.38740000
Si              -1   26.18440400   17.30889800   24.28370100
Si              -1   25.53890000   16.46070000   13.79910000
Si              -1   22.43620000   16.45450000   13.78170000
Si              -1   21.43232300   17.30478400   24.33028700
Si               0   23.72113200   16.47934900   22.44495200
O               -1   27.51420100   16.79280300   23.59160000
O               -1   26.19880000   16.81070200   25.79170100
O               -1   23.98640000   16.80670000   13.76840000
O               -1   21.84394800   16.68732500   25.72612600
O                0   22.28436900   16.65308000   23.10070800
O                0   24.85075500   16.73436600   23.55045300
O               -1   28.07080000   17.28430000   21.09290000
O                0   23.88305400   17.29224900   21.08218500
Si              -1   22.43622800   16.45448900   27.16468800
O               -1   23.98640000   16.80670000   27.15140000
Si              -1   21.57610000   18.77470000   15.57810000
Si              -1   23.88300000   19.34740100   17.54110000
Si              -1   28.60580000   19.35730000   17.59180000
Si              -1   26.30070000   18.72580000   15.68250000
O               -1   22.57280000   18.83640000   16.80640000
O               -1   23.85820100   18.73089900   19.01859900
O               -1   28.09290000   18.68320000   18.92890000
O               -1   27.73250000   18.82250000   16.37680000
O               -1   25.15760000   18.79860000   16.78230000
O               -1   21.70190000   17.35990000   14.86050000
O               -1   26.25690000   17.31610000   14.94080000
Si              -1   24.44469800   18.67980200   20.49210000
Si              -1   27.58730000   18.64580000   20.43180000
O               -1   26.01460000   18.72099900   20.46130000
Si              -1   18.61170000    7.35530000   15.81870000
Si              -1   16.27670000    6.50160000   17.65660000
O               -1   17.68140000    6.80940000   16.98840000
O               -1   18.48430000    8.91670000   15.75050000
O               -1   16.11570000    7.38050000   18.99050000
O               -1   20.10210000    6.90890000   16.16400000
Si              -1   18.59480000   10.49120000   15.86570000
Si              -1   16.28970000   11.12270000   17.77500000
O               -1   17.72150000   11.02600000   17.08070000
O               -1   16.24590000   12.53240000   18.51670000
O               -1   16.13770000    9.96340000   18.84590000
O               -1   20.10210000   10.79520000   16.16400000
Si              -1   15.59930000    8.73030000   19.65690000
Si              -1   15.52790000   13.38780000   19.65840000
Si              -1   18.46789800    8.82520900   24.57090000
Si              -1   16.16100000    9.39790000   22.60790000
O               -1   17.47120000    8.88690000   23.34260000
O               -1   16.18580000    8.78140000   21.13040000
Si              -1   18.47328800   13.38209300   24.45309200
Si              -1   16.17340300   12.53959200   22.55679900
O               -1   17.50319500   13.05571400   23.24890100
O               -1   16.18780000   13.03780000   21.04880000
O               -1   16.11170000   10.96430000   22.57180000
Si              -1   18.59480000   19.35730000   15.86570000
Si              -1   16.28970000   18.72580000   17.77500000
O               -1   17.72150000   18.82250000   17.08070000
O               -1   16.24590000   17.31610000   18.51670000
O               -1   20.10210000   19.05330000   16.16400000
Si              -1   15.52790000   16.46070000   19.65840000
Si              -1   18.47328900   16.46640000   24.45309800
Si              -1   16.17340000   17.30890000   22.55680000
O               -1   17.50320000   16.79280000   23.24890000
O               -1   16.18780000   16.81070000   21.04880000
O               -1   19.94190300    9.10378100   23.98500200
Si              -1   26.17198400    9.39791800   24.23261800
Si              -1   21.44919600    9.40783000   24.28329000
Si              -1   23.75427100    8.77632300   22.37401200
O               -1   22.32250600    8.87298000   23.06831400
O               -1   24.89743200    8.84907100   23.47376800
O               -1   23.79810500    7.36659900   21.63230200
O                0   23.78423400   10.02076700   21.34479400
O                0   19.88901000   12.84511700   23.92876100
Si              -1   28.48429900   13.38210700   22.38739800
Si               0   26.18823700   12.60228700   24.36617900
Si              -1   25.53890000   13.38780000   13.79910000
Si              -1   22.43620000   13.39400000   13.78170000
Si               0   21.43686700   12.56361500   24.27181000
Al               0   23.81574600   13.29066500   22.53625600
O                0   27.53735500   13.10929100   23.64786100
O                0   26.42312900   12.89340100   25.91993000
O               -1   23.98640000   13.04180000   13.76840000
O                0   21.80546300   13.31281200   25.66731700
O                0   22.20053800   13.12324100   22.98751300
O                0   24.88997300   13.39503700   23.85685000
O                0   26.05672900   11.01170500   24.12090000
O                0   21.72534800   10.99163900   24.52577700
O               -1   28.07080900   12.56419600   21.09290000
O                0   24.29909200   12.65612100   21.03272800
Si              -1   25.53890100   13.38779200   27.18206100
Si              -1   22.43620300   13.39399500   27.16466200
O               -1   23.98639900   13.04180200   27.15148000
Si              -1   21.57070000    6.51690000   15.69590000
Si              -1   23.87060000    7.35940000   17.59220000
O               -1   22.54080000    6.84330000   16.90010000
O               -1   23.85620000    6.86120000   19.10020000
O               -1   23.93230000    8.93470000   17.57720200
Si              -1   21.57610200   11.07380200   15.57809900
Si              -1   23.88300000   10.50110300   17.54109200
Si              -1   28.60579900   10.49120000   17.59180000
Si              -1   26.30069800   11.12270200   15.68249800
O               -1   22.57279600   11.01209500   16.80640300
O                0   23.75864100   11.16533700   18.99562300
O               -1   28.09290200   11.16530000   18.92890100
O               -1   27.73250000   11.02600000   16.37680000
O               -1   25.15760500   11.04989600   16.78230500
O               -1   21.70190000   12.48860000   14.86050000
O               -1   26.25690000   12.53240000   14.94080000
Si              -1   24.51609800    6.51120100   20.49059800
Si               0   24.44826600   11.18300200   20.44735800
Si              -1   27.58730000   11.20270400   20.43179900
O                0   26.02267200   10.83971300   20.36662000
H               -1   18.18873300   18.67676400   14.62760500
H               -1   18.11845800   11.11725200   14.62390400
H               -1   15.19714100    6.75932700   16.69273800
H               -1   15.23149700   11.05530700   16.75688100
H               -1   15.23149700   18.79319300   16.75688100
H               -1   18.22886700    6.78109600   14.52076700
H               -1   21.88279300   16.67205000   12.43733700
H               -1   21.88279300   13.17645000   12.43733700
H               -1   26.15350000   13.06182600   12.50414500
H               -1   21.95393600    7.27493700   14.49614600
H               -1   21.63479300    5.08654600   15.36291400
H               -1   21.83279100    9.99633200   14.61162600
H               -1   25.04182900    6.81901800   16.88714000
H               -1   16.25200300    5.09462400   18.08169700
H               -1   14.13008800    8.76885800   19.68572500
H               -1   14.09336800   13.06809100   19.68676700
H               -1   14.09336800   16.78040900   19.68676700
H               -1   16.14877600   19.80062700   18.76786800
H               -1   16.11587100   18.77770700   22.57078600
H               -1   15.00217100   16.76851800   23.26186000
H               -1   15.00217100   13.07998200   23.26186000
H               -1   14.97636300    8.88783500   23.31314300
H               -1   18.09006400   17.22443700   25.65285400
H               -1   18.09006500   12.62406400   25.65285500
H               -1   18.21120900    9.90266800   25.53737400
H               -1   18.35169400    7.51829700   25.23377400
H               -1   21.92554100    8.78174500   25.52509500
H               -1   21.75660000   12.55604600   28.16313700
H               -1   21.75660000   17.29245400   28.16313700
H               -1   21.55173100   18.76854500   24.39423500
H               -1   26.19976300   12.60047300   28.23294500
H               -1   26.15977600   19.80062700   14.68963200
H               -1   30.01737400   19.00915700   17.37465000
H               -1   26.15350000   16.78667400   12.50414500
H               -1   30.02041100   10.77650600   17.31184300
H               -1   24.28119800    5.09811100   20.82060300
H               -1   28.50316000    9.02869700   17.69880600
H               -1   26.15977600   10.04787300   14.68963200
H               -1   29.84166800   13.01978900   22.82004600
H               -1   29.84166800   16.82871000   22.82004600
H               -1   28.15921600   19.77848600   21.17398200
H               -1   26.12687100   18.77770700   24.26971400
H               -1   26.24650400   17.16219800   28.30363200
Si              -1   25.50187100   16.68345000   27.13008000
H               -1   28.46835600   20.81742000   17.69209800
H               -1   23.94043500   19.82793100   21.25918000
H               -1   21.92333300   19.83436800   14.62027300
H               -1   23.90561000   20.81624500   17.59478300
H               -1   26.19476900    8.83189900   25.58907500
H               -1   28.15921600   10.07001400   21.17398200
H               -1   27.38585700    8.92447400   23.55192500
H               -1   25.95063200    6.83090900   20.46223300
H               -1   18.40243500   20.80725400   15.71897300
H                0   24.00483700   14.90035300   20.82827000
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-02-16 17:12:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

那就换小点的基组重新优化试试

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
4楼2015-02-17 21:37:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

qchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2, 谢谢交流 2015-03-02 18:04:13
你的节点配置是怎么样的？
有这么多的内存吗？

这个频率的计算是基于优化了吗？为什么不是从chk文件里读的结构？
我现在用1GB内存，算到l401还没有出错
赞一下 回复此楼
2楼2015-02-17 09:15:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一棵草12

新虫 (初入文坛)
单节点配置物理内存60G，我分配的50G内存是属于合理的范围的。
我在freq-b3.gjf文件中%chk=freq-b3.chk，所以从chk文件中读取结构。
每次都是运行到了l1002才错。

我怀疑是优化做的不太好，未能有效的收敛，导致运算过程中内存不断的消耗，消耗量最终超过了物理内存量而溢出了……本人菜鸟，想听听大伙的建议，谢谢。
赞一下 回复此楼
3楼2015-02-17 15:12:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭