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0342402木虫 (小有名气)
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[交流]
【求助】QSAR问题紧急求助高人
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本人近日做QSAR出现了如下问题，用的软件是SYBYL的COMFA，用Leave-one-out法计算，得到的r平方是 -0.136。我很纳闷，怎么能是负的呢。我设施的主组分数是6，哪位高人知道，可以点播一下。 多谢多谢 [ Last edited by zzgyb on 2008-6-11 at 14:07 ] |
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4楼2008-06-12 21:03:46
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zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与，化学区正在举办十大“耐思”版主评选，http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527，欢迎你去投票支持计模版版主！
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COMFA最关键的是分子叠合，出现负值很可能是你分子叠合上的问题，目前分子叠合用分子对接较多，但是对接后构象的选择很重要，也很难。不能一味的只最求选择打分高的构象。我建议你调整叠合构象。 另外看看你的活性数据有没有转换成负对数，转换有没有正确。 某些分子可能是个奇异点，有时去掉了模型就会变好。 不要一味的只追求交叉验证的Q2，还要看立体场，静电场是否合理，模型的预测能力如何。 |
2楼2008-06-11 14:49:57
0342402
木虫 (小有名气)
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3楼2008-06-11 19:55:29