24小时热门版块排行榜    

查看: 684  |  回复: 2
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 52nana 的 3 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

52nana

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】结构优化得到的最优结构问题

下面这个是在cup_lee 发的"MS建模小结"中看到的:
引用回帖:
优化的时候固定所有原子的位置,选择optimize cell,然后设定优化的步数,CASTEP会算到设定的步数才停止。完事后查看.castep 文件,里面有各个步数的能量,导出后找出能量最小的一个。
注意,优化完的那个构型并不是能量最低的构型,而是优化步数进行到最后一步时的构型!!!

有三个问题和大家讨论一下:
一、设置结构优化时,选择optimize cell就行了吧,为什么要“固定所有原子位置”呢?有必要吗?

二、“然后设定优化的步数,CASTEP会算到设定的步数才停止。”这里面的“步数”是max scf cycles还是geom max iteraction呢?
就我算的情况看,优化计算时都没有到以上两个设定值,它算到能量最低的结构后再算几步就会停止。

三、引用中蓝色部分,优化完给出的那个构型,也就是Final Configuration,应该是能量最低的构型吧?好像后续的继续都是在这个构型的基础上的。
我一般结构优化计算好以后,在得到的3D结构模型上选择计算其他性质。

金币不多,每个问题解决了就给一个金币,请大家指导!

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-26 at 16:54 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spur

金虫 (正式写手)

欢迎常来小木虫讨论问题!我认同楼主的观点。
另外,你每天可以从“今日红包”领0.5~1.5个金币,经常参与讨论或者提供好的资源都可以得到金币。
3楼2008-06-10 16:57:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,化学区正在举办十大“耐思”版主评选,http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527,欢迎你去投票支持计模版版主!
应该没有必要固定所有原子吧,除非是算特定的晶体构型或是不考虑驰豫。
好像如果优化收敛的话,最后的优化的能量值是最低的,据我的计算是这样的。如果是在优化步数前已经收敛,那么最终的能量值是相差无几的。不知道其他的是这样不。也希望高手解答一下。

[ Last edited by aylayl08 on 2008-6-10 at 16:04 ]
珍惜拥有,快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
2楼2008-06-10 16:01:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 朋友圈看到的 +4 wangzilk 2026-08-18 4/200 2026-08-18 18:31 by Niubile666
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +50 医学老男孩 2026-08-13 109/5450 2026-08-18 16:56 by 医学老男孩
[教师之家] 两姐妹,一个辛辛苦苦30岁工作当大学教师,另一个23岁就工作当开车教练 +3 瞬息宇宙 2026-08-11 7/350 2026-08-18 16:42 by LNP@mRNA
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 8/400 2026-08-18 11:47 by gltch
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +4 Tide man 2026-08-14 5/250 2026-08-18 11:35 by Tide man
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
信息提示
请填处理意见