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52nana

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】结构优化得到的最优结构问题

下面这个是在cup_lee 发的"MS建模小结"中看到的:
引用回帖:
优化的时候固定所有原子的位置,选择optimize cell,然后设定优化的步数,CASTEP会算到设定的步数才停止。完事后查看.castep 文件,里面有各个步数的能量,导出后找出能量最小的一个。
注意,优化完的那个构型并不是能量最低的构型,而是优化步数进行到最后一步时的构型!!!

有三个问题和大家讨论一下:
一、设置结构优化时,选择optimize cell就行了吧,为什么要“固定所有原子位置”呢?有必要吗?

二、“然后设定优化的步数,CASTEP会算到设定的步数才停止。”这里面的“步数”是max scf cycles还是geom max iteraction呢?
就我算的情况看,优化计算时都没有到以上两个设定值,它算到能量最低的结构后再算几步就会停止。

三、引用中蓝色部分,优化完给出的那个构型,也就是Final Configuration,应该是能量最低的构型吧?好像后续的继续都是在这个构型的基础上的。
我一般结构优化计算好以后,在得到的3D结构模型上选择计算其他性质。

金币不多,每个问题解决了就给一个金币,请大家指导!

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-26 at 16:54 ]
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,化学区正在举办十大“耐思”版主评选,http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527,欢迎你去投票支持计模版版主!
应该没有必要固定所有原子吧,除非是算特定的晶体构型或是不考虑驰豫。
好像如果优化收敛的话,最后的优化的能量值是最低的,据我的计算是这样的。如果是在优化步数前已经收敛,那么最终的能量值是相差无几的。不知道其他的是这样不。也希望高手解答一下。

[ Last edited by aylayl08 on 2008-6-10 at 16:04 ]
珍惜拥有,快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
2楼2008-06-10 16:01:42
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spur

金虫 (正式写手)

欢迎常来小木虫讨论问题!我认同楼主的观点。
另外,你每天可以从“今日红包”领0.5~1.5个金币,经常参与讨论或者提供好的资源都可以得到金币。
3楼2008-06-10 16:57:04
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