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Tina787

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】DMOL3计算小分子吸附

我想把优化好的小分子放在团簇吸附位上方,然后能量计算,并控制两者之间的距离,请问该如何把小分子放上去呢?还有,reaction coordinate怎么控制啊?

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-26 at 16:45 ]
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goodman959

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
选择3D结构图为当前页,选Modify--Constraints-Atom-勾选上Fix cartesian position 选择X Y Z 坐标即可,不过这之前要想好 固定坐标的目的是什么,比如防止被吸附物变形
4楼2008-06-29 11:05:37
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csfn

荣誉版主 (知名作家)

优秀超版优秀版主优秀区长

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
分子放上去,通过在团簇上一个原子一个原子加上去即可

reaction coordinate自己设置即可
2楼2008-06-08 21:15:38
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Tina787

金虫 (初入文坛)

呵呵,谢谢哦!可是reaction coordinate 怎么设置呢?能否说清除一点?谢谢喔!
3楼2008-06-10 16:05:14
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