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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】DMOL3计算小分子吸附
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Tina787

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】DMOL3计算小分子吸附

我想把优化好的小分子放在团簇吸附位上方，然后能量计算，并控制两者之间的距离，请问该如何把小分子放上去呢？还有，reaction coordinate怎么控制啊？

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-26 at 16:45 ]
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1楼 2008-06-08 16:13:38
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csfn

荣誉版主 (知名作家)

优秀超版优秀版主优秀区长
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
分子放上去，通过在团簇上一个原子一个原子加上去即可

reaction coordinate自己设置即可
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2楼2008-06-08 21:15:38
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Tina787

金虫 (初入文坛)
呵呵，谢谢哦！可是reaction coordinate 怎么设置呢？能否说清除一点？谢谢喔！
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3楼2008-06-10 16:05:14
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goodman959

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
选择3D结构图为当前页，选Modify--Constraints-Atom-勾选上Fix cartesian position 选择X Y Z 坐标即可，不过这之前要想好 固定坐标的目的是什么，比如防止被吸附物变形
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4楼2008-06-29 11:05:37
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